More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2243 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  81.98 
 
 
456 aa  742    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 
455 aa  916    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  82.42 
 
 
452 aa  746    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  55.84 
 
 
461 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  50.11 
 
 
456 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  48.38 
 
 
428 aa  391  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  45.37 
 
 
405 aa  355  8.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  43.63 
 
 
472 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.09 
 
 
489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  42.05 
 
 
478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  42.16 
 
 
480 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  43.45 
 
 
463 aa  333  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  43.18 
 
 
518 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.05 
 
 
463 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.31 
 
 
483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.63 
 
 
497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.63 
 
 
488 aa  310  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.91 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  40.91 
 
 
488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.42 
 
 
472 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.09 
 
 
472 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.27 
 
 
460 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.61 
 
 
522 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.28 
 
 
487 aa  295  8e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.15 
 
 
464 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  40.87 
 
 
438 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  41.37 
 
 
469 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  40.96 
 
 
472 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  38.2 
 
 
490 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  38.43 
 
 
461 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  44.08 
 
 
553 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.67 
 
 
464 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  37.08 
 
 
456 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.3 
 
 
538 aa  236  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.23 
 
 
497 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.47 
 
 
462 aa  229  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.97 
 
 
497 aa  212  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.67 
 
 
494 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.75 
 
 
462 aa  207  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.94 
 
 
485 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.26 
 
 
517 aa  202  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  34.96 
 
 
466 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.95 
 
 
473 aa  199  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.24 
 
 
477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.73 
 
 
466 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.63 
 
 
497 aa  192  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.63 
 
 
465 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.5 
 
 
492 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.27 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.14 
 
 
562 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.55 
 
 
464 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.31 
 
 
449 aa  147  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.85 
 
 
444 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.81 
 
 
446 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.97 
 
 
469 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.55 
 
 
471 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.18 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.88 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.41 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.41 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.05 
 
 
469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  26.11 
 
 
471 aa  134  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  26.98 
 
 
423 aa  133  6.999999999999999e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.79 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.84 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.65 
 
 
450 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.11 
 
 
472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.55 
 
 
472 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.89 
 
 
473 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.89 
 
 
473 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.56 
 
 
472 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  25.84 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.3 
 
 
468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.97 
 
 
475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.89 
 
 
466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  24.15 
 
 
436 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0068  outer membrane protein TolC, putative  26.98 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.896077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.68 
 
 
457 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.77 
 
 
452 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.77 
 
 
452 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.2 
 
 
475 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  24.53 
 
 
436 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.19 
 
 
471 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.08 
 
 
451 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.02 
 
 
452 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.06 
 
 
636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0246  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.97 
 
 
538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 
457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  24.65 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.08 
 
 
459 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.62 
 
 
480 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  24.14 
 
 
425 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.21 
 
 
524 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.39 
 
 
449 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.59 
 
 
431 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.32 
 
 
491 aa  106  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.25 
 
 
452 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.35 
 
 
609 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>