More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2207 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  90.47 
 
 
472 aa  815    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
472 aa  941    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  89.62 
 
 
490 aa  828    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  64.29 
 
 
444 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  63.98 
 
 
465 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  63.98 
 
 
441 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  66.02 
 
 
460 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  62.86 
 
 
441 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  59.08 
 
 
457 aa  488  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  62.26 
 
 
457 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  59.21 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  61.31 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  61.31 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  60.8 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  56.63 
 
 
469 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  58.53 
 
 
474 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  57.31 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  54.67 
 
 
459 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  56.42 
 
 
444 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  55.88 
 
 
442 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  54.39 
 
 
457 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  59.1 
 
 
474 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  58.25 
 
 
470 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  55.88 
 
 
474 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  55.75 
 
 
461 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  56.34 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  55.79 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  56.42 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  54.83 
 
 
446 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  56.77 
 
 
436 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  52.21 
 
 
450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.92 
 
 
418 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  54.13 
 
 
442 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  57.99 
 
 
415 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  54.94 
 
 
435 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.5 
 
 
426 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  56.25 
 
 
423 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  60.57 
 
 
416 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  60.29 
 
 
447 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  55.85 
 
 
435 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  61.33 
 
 
448 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  53.88 
 
 
432 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  51.16 
 
 
432 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  47.45 
 
 
414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  47.18 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.78 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  46.46 
 
 
432 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  47.56 
 
 
433 aa  299  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  47.81 
 
 
445 aa  299  8e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  47.04 
 
 
426 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  49.59 
 
 
426 aa  296  7e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  49.59 
 
 
426 aa  296  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  49.59 
 
 
426 aa  296  7e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  49.59 
 
 
426 aa  296  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  49.59 
 
 
426 aa  296  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  47.12 
 
 
439 aa  296  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  49.59 
 
 
426 aa  296  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  49.59 
 
 
426 aa  296  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  49.59 
 
 
426 aa  296  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  49.32 
 
 
426 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  49.32 
 
 
426 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  49.32 
 
 
426 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  49.32 
 
 
426 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  49.32 
 
 
426 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  43.55 
 
 
441 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  49.32 
 
 
426 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.99 
 
 
433 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  47.81 
 
 
426 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.99 
 
 
433 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.81 
 
 
421 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.63 
 
 
441 aa  293  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  45.97 
 
 
433 aa  292  9e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  47.81 
 
 
426 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  47.81 
 
 
426 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  51.27 
 
 
436 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  45.05 
 
 
415 aa  290  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.53 
 
 
429 aa  291  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  46.72 
 
 
428 aa  290  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  46.72 
 
 
428 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  46.46 
 
 
433 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.26 
 
 
429 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  46.72 
 
 
428 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.32 
 
 
436 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  51.49 
 
 
428 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.4 
 
 
489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  45.6 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.4 
 
 
489 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  41.78 
 
 
429 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  45.43 
 
 
426 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  45.97 
 
 
450 aa  286  8e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  44.88 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  44.88 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  44.88 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  45.97 
 
 
450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  46.09 
 
 
441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.6 
 
 
440 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.61 
 
 
461 aa  283  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  47.97 
 
 
429 aa  282  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  48.14 
 
 
454 aa  280  6e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  48.14 
 
 
454 aa  280  6e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>