122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2004 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  93.19 
 
 
470 aa  903    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  93.19 
 
 
472 aa  903    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  68.87 
 
 
472 aa  684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  957    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  59.96 
 
 
466 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  53.26 
 
 
491 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  53.59 
 
 
464 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  53.08 
 
 
469 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  53.05 
 
 
461 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  53.05 
 
 
461 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  53.47 
 
 
461 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  51.06 
 
 
464 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  49.47 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  48.63 
 
 
474 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  47.97 
 
 
474 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 
477 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 
473 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  43.83 
 
 
471 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 
506 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  42.53 
 
 
474 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  44.61 
 
 
490 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  41.4 
 
 
474 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  44.61 
 
 
490 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  41.76 
 
 
475 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  42.06 
 
 
480 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 
490 aa  361  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  40.81 
 
 
470 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  43.95 
 
 
495 aa  355  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
483 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  38.94 
 
 
483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  43.04 
 
 
469 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  40.43 
 
 
480 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  40.08 
 
 
483 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 
481 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 
480 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  40.76 
 
 
524 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  38.17 
 
 
475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  38.56 
 
 
486 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  38.92 
 
 
466 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  39.15 
 
 
477 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  38.97 
 
 
482 aa  340  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  38.94 
 
 
477 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  38.22 
 
 
474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  38.12 
 
 
477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  38.92 
 
 
476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  39.45 
 
 
481 aa  336  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  36.81 
 
 
475 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  36.81 
 
 
475 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  36.81 
 
 
475 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  42.12 
 
 
461 aa  330  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  38.35 
 
 
475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  40.9 
 
 
484 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  38.46 
 
 
474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  37.45 
 
 
482 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  37.71 
 
 
488 aa  322  9.000000000000001e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  41.51 
 
 
477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  39.69 
 
 
461 aa  316  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  36.32 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.45 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 
471 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 
464 aa  297  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  38.5 
 
 
455 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 
479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  35.62 
 
 
467 aa  283  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  37.26 
 
 
476 aa  282  9e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 
463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  35.19 
 
 
470 aa  260  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  35.19 
 
 
470 aa  260  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  35.03 
 
 
470 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  35.24 
 
 
472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  35.03 
 
 
469 aa  250  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  34.39 
 
 
483 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  34.96 
 
 
469 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  33.26 
 
 
474 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  34.96 
 
 
469 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 
462 aa  229  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  32.72 
 
 
491 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  46.15 
 
 
149 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  26.46 
 
 
431 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  26.85 
 
 
440 aa  87.4  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  25.52 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  25.65 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  24.84 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.91 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  24.62 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  25.24 
 
 
504 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  25.81 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  22.37 
 
 
488 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  24.95 
 
 
503 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  24.47 
 
 
504 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  23.62 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 
490 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  24.12 
 
 
490 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  24.14 
 
 
505 aa  57.4  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  23.19 
 
 
491 aa  56.6  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  22.74 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
219 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
219 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
219 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 
428 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>