More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1965 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 80 aa  163  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  97.5 
 
 		 80 aa  159  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  97.5 
 
 		 80 aa  159  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  85.53 
 
 		 80 aa  139  9e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  85.53 
 
 		 80 aa  139  9e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  79.49 
 
 		 78 aa  136  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  76.92 
 
 		 79 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  76.92 
 
 		 79 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  76.92 
 
 		 78 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  75.95 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  73.08 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  68.35 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 		 80 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  71.05 
 
 		 80 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  71.05 
 
 		 80 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  72 
 
 		 80 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  72.73 
 
 		 82 aa  115  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  68.83 
 
 		 82 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  67.95 
 
 		 78 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  65.79 
 
 		 76 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  67.5 
 
 		 83 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 		 82 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 76 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 		 86 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 		 78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 76 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  71.83 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 79 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  70.42 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 97 aa  100  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  62.32 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 100 aa  90.9  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  62.69 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 97 aa  88.6  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  65.15 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  62.86 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  59.42 
 
 		 86 aa  87.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  61.76 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  59.42 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 94 aa  87  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  59.7 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  59.09 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  57.58 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  57.58 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  58.33 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  60.87 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  64.18 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  58.57 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 		 86 aa  83.6  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0864  ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1120  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  60.61 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  57.75 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  60.94 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  60.94 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19941  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  57.97 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  59.7 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  59.7 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0212  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>