More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1678 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1490  transporter, putative  86.68 
 
 
621 aa  1105    Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  86.36 
 
 
621 aa  1102    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  100 
 
 
623 aa  1264    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  52.27 
 
 
606 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  52.82 
 
 
629 aa  608  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  49.13 
 
 
609 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3806  ABC transporter domain protein  48.78 
 
 
621 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  47.87 
 
 
616 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4264  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.15 
 
 
590 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26783  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5526  ABC transporter domain protein  44.42 
 
 
587 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.44 
 
 
587 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  35.44 
 
 
587 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  34.05 
 
 
610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  34.96 
 
 
621 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  32.66 
 
 
579 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  33.33 
 
 
613 aa  323  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  33.66 
 
 
630 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  33.21 
 
 
614 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  34.1 
 
 
588 aa  321  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34 
 
 
589 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  33.7 
 
 
589 aa  316  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  33.7 
 
 
589 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  32.86 
 
 
589 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  33.7 
 
 
589 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  32.86 
 
 
589 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  34.99 
 
 
636 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  32.64 
 
 
586 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  35.27 
 
 
578 aa  309  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  34.01 
 
 
577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  33.59 
 
 
583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.76 
 
 
592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  32.97 
 
 
575 aa  306  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  33.76 
 
 
583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  33.7 
 
 
593 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  31.19 
 
 
651 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  33.46 
 
 
589 aa  296  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  32.5 
 
 
713 aa  294  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  32.65 
 
 
614 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  32.46 
 
 
614 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  30.64 
 
 
660 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 
588 aa  290  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  31.01 
 
 
642 aa  289  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  36.58 
 
 
572 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.42 
 
 
588 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
588 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
588 aa  287  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.42 
 
 
584 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.42 
 
 
588 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
588 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  30.46 
 
 
674 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.23 
 
 
588 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  31.14 
 
 
590 aa  285  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  30.81 
 
 
704 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  30.81 
 
 
712 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  33.88 
 
 
614 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  29.54 
 
 
704 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  30.74 
 
 
606 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 
577 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  30.51 
 
 
591 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.73 
 
 
599 aa  280  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  29.7 
 
 
666 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  30.31 
 
 
708 aa  276  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  30.71 
 
 
595 aa  273  9e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  31.98 
 
 
701 aa  270  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  30.11 
 
 
596 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  31.13 
 
 
588 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  31.92 
 
 
557 aa  262  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  31.33 
 
 
596 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  31.3 
 
 
557 aa  252  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  29.49 
 
 
712 aa  251  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  32.15 
 
 
588 aa  250  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  30.16 
 
 
553 aa  246  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  29.98 
 
 
602 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.31 
 
 
549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  28.81 
 
 
626 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  29.06 
 
 
602 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  27.88 
 
 
606 aa  236  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  29.09 
 
 
615 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  28.27 
 
 
595 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  27.7 
 
 
605 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  28.38 
 
 
563 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  31.63 
 
 
603 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  27.67 
 
 
561 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  27.69 
 
 
561 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  27.67 
 
 
561 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.918171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  27.67 
 
 
561 aa  219  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  27.47 
 
 
561 aa  219  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  27.67 
 
 
561 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.74 
 
 
598 aa  219  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  27.47 
 
 
561 aa  217  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  27.47 
 
 
561 aa  217  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  27.47 
 
 
561 aa  216  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  28.28 
 
 
597 aa  214  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  29.69 
 
 
596 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  29.14 
 
 
560 aa  213  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  26.85 
 
 
589 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  27.15 
 
 
632 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1675  ABC transporter, permease protein  28.18 
 
 
571 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0722052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  26.98 
 
 
636 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  26.98 
 
 
634 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>