116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1362 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  86.86 
 
 
145 aa  237  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  86.86 
 
 
145 aa  237  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  58.12 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  54.62 
 
 
133 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  56.45 
 
 
133 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  58.56 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  52.71 
 
 
129 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  60.91 
 
 
120 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  40.91 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 
162 aa  67  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  37.17 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  35.9 
 
 
240 aa  63.9  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  45.05 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  40 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  38.76 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  51.43 
 
 
227 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  39.13 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  39.13 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  35.83 
 
 
123 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  36.45 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  33.88 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  44.23 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  35.04 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  36.61 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  46.15 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  35.82 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  37.14 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  44.23 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  38.53 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  37.04 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  37.4 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  36.19 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  34.92 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  34.68 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  43.24 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  45.95 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  37.8 
 
 
119 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  35.24 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  41.33 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  42.31 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  43.04 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  36.07 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  41.74 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  36.36 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  35.8 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  37.31 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  28.7 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  32.1 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  41.43 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  35.06 
 
 
115 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  35.06 
 
 
119 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  35.06 
 
 
119 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  35.06 
 
 
119 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  35.06 
 
 
119 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  34.72 
 
 
115 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  35.06 
 
 
115 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  35.06 
 
 
119 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 
130 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  40.85 
 
 
132 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.86 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  45.88 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  36.89 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  52 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  52 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  35.06 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  36.61 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32.77 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  52.27 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  40.62 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  44.64 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  45.65 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  45.31 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  45.9 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  45.31 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  45.31 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  36.23 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  42.86 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  42.86 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  28.45 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  30.97 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2523  ribonuclease P protein component  47.06 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0265349  hitchhiker  0.0000065266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2309  ribonuclease P protein component  37.4 
 
 
169 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  39.13 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  31.96 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35.38 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  37.5 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  44.9 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  28.57 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  28.57 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
124 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  40.18 
 
 
165 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>