More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1001 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
206 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.32 
 
 
204 aa  265  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  57.66 
 
 
240 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.9 
 
 
211 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  60.19 
 
 
210 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.42 
 
 
211 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  53.88 
 
 
208 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  49.53 
 
 
208 aa  187  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  50.5 
 
 
205 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.28 
 
 
208 aa  175  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.21 
 
 
207 aa  175  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  54.33 
 
 
215 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  50.88 
 
 
207 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  50.6 
 
 
207 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  50.29 
 
 
207 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 
204 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  49.71 
 
 
207 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  49.71 
 
 
207 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  49.71 
 
 
207 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  49.71 
 
 
207 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.26 
 
 
215 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.33 
 
 
215 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  49.12 
 
 
207 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  46.19 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  38.69 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  36.1 
 
 
205 aa  134  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.06 
 
 
204 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  40.93 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 
211 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  40.58 
 
 
206 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.18 
 
 
211 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0202  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.75 
 
 
159 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.15 
 
 
205 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.31 
 
 
207 aa  121  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.12 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.07 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.45 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.25 
 
 
211 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
203 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.48 
 
 
206 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  37.5 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
205 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.45 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  37 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  35.03 
 
 
205 aa  112  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.96 
 
 
206 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.96 
 
 
206 aa  111  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.78 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  34.95 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.1 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.96 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.78 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  32.84 
 
 
206 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  32.84 
 
 
206 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.84 
 
 
206 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.84 
 
 
206 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.84 
 
 
206 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  33.33 
 
 
213 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  32.84 
 
 
206 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.84 
 
 
206 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.84 
 
 
206 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.12 
 
 
208 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.69 
 
 
207 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  37 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  40.61 
 
 
212 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.35 
 
 
206 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  32.32 
 
 
207 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.82 
 
 
207 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.35 
 
 
206 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.54 
 
 
211 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 
211 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 
233 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.35 
 
 
206 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 
203 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 
207 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.35 
 
 
206 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 
211 aa  104  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  34.68 
 
 
205 aa  104  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  32.2 
 
 
209 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
205 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  32.2 
 
 
209 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
210 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.35 
 
 
206 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.95 
 
 
206 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  40.46 
 
 
207 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 
238 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 
211 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
211 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.02 
 
 
206 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  35.32 
 
 
203 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>