262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0893 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
110 aa  211  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  54.13 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4742  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 
124 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0122495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  50.91 
 
 
119 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  50 
 
 
124 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 
263 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  38.53 
 
 
201 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  41.28 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 
165 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  44.21 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1676  gp68  38.61 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0556  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
62 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  37.5 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  38.94 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2413  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383209  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 
245 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0571  transcriptional regulator, XRE family  41.25 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
176 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3170  putative phage-related transcriptional regulator  29.09 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0151351  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
182 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
161 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
161 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
161 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1040  transcriptional regulator, XRE family  32.41 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
178 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 
255 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  41.82 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2943  putative phage-related transcriptional regulator  28.18 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 
183 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4440  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0604  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 
256 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 
252 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 
255 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 
175 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  38.18 
 
 
156 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 
165 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 
178 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
230 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  47.83 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  37.5 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  37.5 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  37.5 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  37.5 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  37.5 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  39.66 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  37.5 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 
325 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1681  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.527285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  37.5 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 
191 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 
223 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 
277 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.48 
 
 
305 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  35.71 
 
 
224 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 
233 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 
187 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
60 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  43.64 
 
 
196 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  41.07 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 
218 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  40.82 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  35.71 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  42.11 
 
 
212 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  33.93 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3859  hypothetical protein  37.93 
 
 
233 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
227 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 
317 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 
212 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>