More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0860 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 213 aa  433  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  86.79 
 
 		 213 aa  377  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  87.2 
 
 		 213 aa  377  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  53.14 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  54.63 
 
 		 210 aa  227  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  50.51 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  52.02 
 
 		 205 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  48.47 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  48.99 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  45.73 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  44.62 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  45.05 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  47.18 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  44.55 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  45.77 
 
 		 277 aa  155  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  44.9 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  44.1 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  45.08 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  40.48 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  45.4 
 
 		 221 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  40.48 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  44.85 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  42.78 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  43.37 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  41.63 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  44.67 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  40 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  43.81 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  43.92 
 
 		 195 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  41.8 
 
 		 211 aa  138  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  38.57 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  43.23 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  40.41 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  44.03 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  37.25 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  37.56 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  36.04 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  41.9 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  34.07 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  35.12 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  34.64 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  37.14 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  29.35 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  35.25 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  35.5 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  36.47 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4504  methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  31.76 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  30.89 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  35.36 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  38.35 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  38.35 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  38.35 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  38.35 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  33.57 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  33.57 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  29.56 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  33.57 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  33.57 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  30.91 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  35.21 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  33.57 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  33.57 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  33.57 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  33.57 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  29.23 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  31.46 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4356  methyltransferase GidB  29.65 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  31.55 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4492  methyltransferase GidB  29.8 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  29.79 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  38.35 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  34.71 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  32.89 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  27.96 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  30.86 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4511  methyltransferase GidB  29.14 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  32.88 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  33.09 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  31.37 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  33.99 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  36.75 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  33.91 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  31.94 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  31.43 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  32.87 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  29.82 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  30.38 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  30.18 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  30.38 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>