93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0843 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
130 aa  262  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  92 
 
 
126 aa  237  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  90.24 
 
 
142 aa  228  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  66.39 
 
 
125 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  66.39 
 
 
125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1245  XRE family transcriptional regulator  65.85 
 
 
127 aa  150  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.664422  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  60.68 
 
 
125 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  65.45 
 
 
120 aa  148  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  60.83 
 
 
121 aa  147  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  54.62 
 
 
131 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  57.26 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  54.21 
 
 
131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3601  XRE family transcriptional regulator  55.34 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000201761  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4677  transcriptional regulator, XRE family  45.36 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  41.24 
 
 
115 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4662  hypothetical protein  33.06 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700483  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 
321 aa  50.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  36.7 
 
 
468 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 
301 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  40 
 
 
61 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
223 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.08 
 
 
256 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  40.68 
 
 
489 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
490 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  42.37 
 
 
200 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  41.07 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  33 
 
 
466 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
474 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  39.29 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  54.05 
 
 
474 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  37.93 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  33.87 
 
 
258 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
495 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 
477 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 
505 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 
477 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  25.23 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  40 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
397 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
397 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 
477 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  34.67 
 
 
212 aa  42.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  36.11 
 
 
475 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
252 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  40.35 
 
 
470 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  42.11 
 
 
475 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 
271 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
478 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  40.35 
 
 
483 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  42.11 
 
 
474 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  40.35 
 
 
470 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 
475 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  42.11 
 
 
482 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  42.11 
 
 
475 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  42.11 
 
 
475 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
475 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  36.07 
 
 
200 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  34.43 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
474 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  34.43 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  33.77 
 
 
476 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 
505 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  41.18 
 
 
484 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 
504 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  35.59 
 
 
495 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 
424 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 
231 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 
210 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5549  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
232 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361846  hitchhiker  0.00439273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  32.88 
 
 
217 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
209 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  32.88 
 
 
217 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  32.88 
 
 
217 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  35.21 
 
 
302 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 
470 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 
130 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  48.65 
 
 
127 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>