72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0748 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  397  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  96 
 
 
200 aa  387  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  95.5 
 
 
217 aa  387  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  59.28 
 
 
240 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  59.9 
 
 
231 aa  218  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  60 
 
 
231 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  60.51 
 
 
230 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  57.51 
 
 
211 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  52 
 
 
211 aa  199  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  47.09 
 
 
239 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  47.45 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  45.6 
 
 
259 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  46.31 
 
 
237 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  44.9 
 
 
247 aa  158  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  44.9 
 
 
275 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  45.55 
 
 
221 aa  154  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  44.04 
 
 
234 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  45.03 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  46.11 
 
 
234 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  44.55 
 
 
249 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  45.32 
 
 
243 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  43.75 
 
 
227 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  44.55 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  44.55 
 
 
247 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  46.47 
 
 
257 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  42.53 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  45.27 
 
 
240 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  40.62 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  38.62 
 
 
210 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  38.02 
 
 
194 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  38.42 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  38.64 
 
 
246 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  37.36 
 
 
252 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  36.13 
 
 
263 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  33.68 
 
 
205 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  35.8 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  34.24 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  34.24 
 
 
210 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  35.2 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  33.54 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  33.54 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  31.63 
 
 
244 aa  85.5  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  33.85 
 
 
212 aa  84.7  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  40.18 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  36.79 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  44.55 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  33.16 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  30.17 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  30.73 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  45.16 
 
 
139 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  46.77 
 
 
119 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  38.2 
 
 
110 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  38.2 
 
 
110 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  40.24 
 
 
524 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  36.17 
 
 
120 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  42.19 
 
 
130 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  38.81 
 
 
140 aa  48.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  39.39 
 
 
121 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  34.38 
 
 
124 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  34.38 
 
 
124 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  34.38 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  35.96 
 
 
120 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  39.13 
 
 
92 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  40.32 
 
 
135 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  34.33 
 
 
113 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0771  hypothetical protein  35.71 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  29.49 
 
 
93 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  40.32 
 
 
79 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.91 
 
 
93 aa  42  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  32.95 
 
 
101 aa  41.6  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>