More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0583 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
315 aa  622  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  88.89 
 
 
315 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  88.46 
 
 
312 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  60.76 
 
 
316 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  61.84 
 
 
316 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  64.5 
 
 
310 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  62.17 
 
 
316 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  61.22 
 
 
325 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  59.79 
 
 
318 aa  349  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  61.09 
 
 
321 aa  345  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  58.39 
 
 
311 aa  344  1e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  56.25 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  59.58 
 
 
315 aa  329  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  57.28 
 
 
313 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  55.67 
 
 
312 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  55.63 
 
 
313 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  55.33 
 
 
353 aa  316  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  57.38 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  54.98 
 
 
328 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  54.98 
 
 
328 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  54.75 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  56.21 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  55.85 
 
 
315 aa  306  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  55.73 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  55.17 
 
 
310 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  55.17 
 
 
310 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  56.39 
 
 
316 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  58.61 
 
 
317 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  55.1 
 
 
308 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  52.74 
 
 
305 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  56.42 
 
 
317 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  54.46 
 
 
328 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  54.48 
 
 
345 aa  292  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  54.83 
 
 
310 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  54.95 
 
 
312 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  55.4 
 
 
317 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  51.19 
 
 
302 aa  290  2e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  55.75 
 
 
317 aa  289  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  55.75 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  50.53 
 
 
295 aa  288  6e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  57.88 
 
 
317 aa  288  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  53.72 
 
 
304 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  51.37 
 
 
313 aa  278  7e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  46.62 
 
 
295 aa  275  5e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  48.68 
 
 
295 aa  275  5e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  51.58 
 
 
302 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 
324 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 
323 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 
323 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  44.56 
 
 
305 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  46.64 
 
 
309 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  43.05 
 
 
301 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  45 
 
 
302 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  43.13 
 
 
328 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  41.4 
 
 
328 aa  215  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  44.92 
 
 
443 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  43.58 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 
304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  45.14 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  40.94 
 
 
301 aa  211  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 
300 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 
300 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 
300 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 
300 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  44.01 
 
 
301 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 
300 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 
300 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 
300 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 
300 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  40.88 
 
 
302 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 
298 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  44.48 
 
 
300 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  41.13 
 
 
303 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  44.48 
 
 
300 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  43.05 
 
 
301 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 
302 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  44.22 
 
 
300 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 
300 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 
300 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  40.47 
 
 
298 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 
300 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 
300 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  40.56 
 
 
317 aa  206  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 
306 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  40.49 
 
 
303 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  41.96 
 
 
313 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  38.74 
 
 
311 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 
306 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 
535 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 
313 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  43.11 
 
 
306 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  44.18 
 
 
301 aa  203  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  43.16 
 
 
306 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 
310 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  40.56 
 
 
534 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  43 
 
 
301 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  40.59 
 
 
300 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  39.37 
 
 
301 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>