30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0479 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  697    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  68.31 
 
 
347 aa  484  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  68.31 
 
 
347 aa  484  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  45.09 
 
 
341 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  35.94 
 
 
371 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  44.19 
 
 
176 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  31.28 
 
 
399 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  30.38 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  29.67 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  30.7 
 
 
431 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  31.22 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  32.31 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  26.98 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  34.39 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  30.5 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  29.46 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  28.8 
 
 
378 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  29.94 
 
 
355 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  30 
 
 
367 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  28.24 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  27.62 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  29.82 
 
 
375 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  26.2 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  27.81 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  26.67 
 
 
443 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  28 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  28.11 
 
 
388 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  26.62 
 
 
401 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  23.46 
 
 
415 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  28.12 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.269027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>