82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0438 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  75.18 
 
 
414 aa  651    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  81.6 
 
 
413 aa  709    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
426 aa  882    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  75.49 
 
 
412 aa  656    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  83.78 
 
 
413 aa  734    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  75.18 
 
 
414 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  97.34 
 
 
413 aa  836    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  76.16 
 
 
413 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  81.55 
 
 
412 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  80.83 
 
 
412 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  97.09 
 
 
413 aa  832    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  80.83 
 
 
412 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  72.25 
 
 
422 aa  631  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  72.64 
 
 
424 aa  631  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  72.64 
 
 
424 aa  630  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  74.24 
 
 
399 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  74.49 
 
 
399 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  74.39 
 
 
407 aa  625  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  72.82 
 
 
412 aa  618  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  47.17 
 
 
417 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  47.75 
 
 
414 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  46.53 
 
 
405 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  46.63 
 
 
414 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  47.09 
 
 
414 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  42.64 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  42.68 
 
 
398 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  43.65 
 
 
399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  42.43 
 
 
401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  42.64 
 
 
398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  42.93 
 
 
401 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  42.42 
 
 
405 aa  335  7.999999999999999e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  43.28 
 
 
398 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
398 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
396 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  42.93 
 
 
397 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  42.07 
 
 
409 aa  329  6e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  43.54 
 
 
392 aa  329  7e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  44.39 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  42.25 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  42.39 
 
 
399 aa  326  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  41.92 
 
 
403 aa  326  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  42 
 
 
401 aa  325  9e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  41.03 
 
 
400 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  41.75 
 
 
401 aa  323  5e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
399 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  41.58 
 
 
399 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  40.98 
 
 
402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  39.85 
 
 
403 aa  317  3e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  39.8 
 
 
403 aa  317  3e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  43.39 
 
 
398 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  39.75 
 
 
401 aa  316  4e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  41.08 
 
 
401 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  39.55 
 
 
394 aa  315  7e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  41.21 
 
 
400 aa  315  8e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  41.16 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  40 
 
 
397 aa  312  5.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  39.41 
 
 
399 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  41.06 
 
 
396 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  39.75 
 
 
405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  40.4 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  40.6 
 
 
404 aa  300  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  41.42 
 
 
403 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  37.84 
 
 
404 aa  293  5e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  29.95 
 
 
408 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  28.95 
 
 
407 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  30.68 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  26.99 
 
 
403 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  26.39 
 
 
407 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  26.39 
 
 
407 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  25.91 
 
 
407 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  24.59 
 
 
415 aa  86.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  21.88 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  22.04 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.55 
 
 
367 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  22.47 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  27.1 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  30.33 
 
 
376 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  19.91 
 
 
413 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0878  Homospermidine synthase  25.14 
 
 
485 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  23.87 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  26.67 
 
 
391 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>