More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0083 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  61.35 
 
 
169 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  60.74 
 
 
174 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  57.41 
 
 
167 aa  194  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  59.51 
 
 
172 aa  184  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  56.97 
 
 
175 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  54.72 
 
 
163 aa  174  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  34.42 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
167 aa  94  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
167 aa  94  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
162 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  33.61 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
167 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
137 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  29.41 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
138 aa  62  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
146 aa  61.6  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
142 aa  61.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 
166 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
142 aa  61.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  33.08 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
120 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
148 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
145 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  33.77 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 
166 aa  58.9  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
161 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
190 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
166 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  31.34 
 
 
160 aa  58.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
212 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  30.77 
 
 
154 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
150 aa  58.2  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
147 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  33.88 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
194 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
194 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  34.58 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  33.06 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  29.17 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
146 aa  55.5  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  33.07 
 
 
138 aa  55.1  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  33.06 
 
 
261 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>