More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0070 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
364 aa  718    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  73.83 
 
 
360 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0103  monosaccharide-transporting ATPase  75.7 
 
 
360 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.628662  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  70.25 
 
 
357 aa  504  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0989  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  70.25 
 
 
363 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  72.41 
 
 
354 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2649  inner-membrane translocator  70.25 
 
 
363 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  69.14 
 
 
350 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  70.41 
 
 
363 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  62.85 
 
 
360 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  64 
 
 
357 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0127  inner-membrane translocator  62.75 
 
 
354 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0126  Monosaccharide-transporting ATPase  62.75 
 
 
354 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  55 
 
 
360 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  55.74 
 
 
360 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  45.29 
 
 
326 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  43.69 
 
 
328 aa  264  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5756  Monosaccharide-transporting ATPase  44.23 
 
 
356 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.166974 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  43.33 
 
 
341 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  46.58 
 
 
319 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  43.25 
 
 
329 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  44.27 
 
 
335 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  44.98 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  44.63 
 
 
317 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  43.61 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.95 
 
 
328 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  44.03 
 
 
319 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  44.65 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  44.95 
 
 
322 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  44.37 
 
 
348 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  43 
 
 
334 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  44.41 
 
 
329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.42 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.42 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.81 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.81 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.81 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  39.86 
 
 
341 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.19 
 
 
345 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
345 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  38.19 
 
 
347 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  35.48 
 
 
345 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  37.01 
 
 
333 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  37.33 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 
310 aa  173  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  38.96 
 
 
348 aa  172  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  36.76 
 
 
405 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  37.63 
 
 
334 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.63 
 
 
342 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.44 
 
 
312 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
342 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  40.52 
 
 
342 aa  169  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 
835 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.06 
 
 
306 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.57 
 
 
310 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  38.73 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.57 
 
 
310 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  34.55 
 
 
333 aa  166  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  35.79 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  39.3 
 
 
309 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  39.38 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  39.17 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.01 
 
 
334 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.59 
 
 
327 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  35.69 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  32.76 
 
 
345 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  38.04 
 
 
325 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.93 
 
 
334 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
334 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
334 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 
311 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  36.68 
 
 
336 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  36.73 
 
 
341 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.83 
 
 
324 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.57 
 
 
334 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 
311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.76 
 
 
341 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 
311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 
311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 
311 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.72 
 
 
311 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.72 
 
 
311 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  32.21 
 
 
345 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
338 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.37 
 
 
311 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.37 
 
 
311 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 
318 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.72 
 
 
311 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
346 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  37.83 
 
 
346 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  36.66 
 
 
342 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  33.24 
 
 
354 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  34.59 
 
 
343 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  37.46 
 
 
322 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.18 
 
 
309 aa  155  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
340 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.01 
 
 
311 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.77 
 
 
323 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>