More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0066 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  51.58 
 
 
281 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  48.11 
 
 
285 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  48.11 
 
 
285 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  47.59 
 
 
300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  47.77 
 
 
285 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  45.91 
 
 
278 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  45.91 
 
 
278 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  44.68 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 
278 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 
276 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  50.36 
 
 
286 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  50.36 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  39.65 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  38.65 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 
276 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 
276 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 
300 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  38.15 
 
 
288 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 
303 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 
297 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
290 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2631  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32450  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  36.74 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  31.99 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
284 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
284 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
284 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  34.15 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3671  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 
285 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0621  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 
278 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.378205  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 
276 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6121  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
289 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
276 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0576  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
284 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6409  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586073  normal  0.525784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  34.42 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2024  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
270 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 
266 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 
266 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 
264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.62 
 
 
277 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 
281 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
267 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 
277 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 
274 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 
281 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 
355 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 
279 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
290 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  31.94 
 
 
432 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
290 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  33.08 
 
 
270 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 
275 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
284 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
432 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
432 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0733  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 
275 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.629568 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
432 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
432 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 
279 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
269 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 
284 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 
312 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
275 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 
284 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 
277 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 
284 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6122  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 
280 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  34.1 
 
 
283 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 
275 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
277 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 
247 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 
266 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 
278 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 
264 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 
268 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 
264 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
275 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
279 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 
275 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 
259 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
272 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>