112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0054 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  84.66 
 
 
1515 aa  2507    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  47.81 
 
 
1538 aa  1368    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  35.77 
 
 
1550 aa  972    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  84.07 
 
 
1510 aa  2485    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  100 
 
 
1578 aa  3093    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  28.81 
 
 
1501 aa  466  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  37.31 
 
 
2140 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  32.44 
 
 
2032 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  39.63 
 
 
1869 aa  359  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  29.34 
 
 
1448 aa  310  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  33.96 
 
 
1423 aa  306  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  28.42 
 
 
1530 aa  305  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  36 
 
 
1428 aa  302  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  34.85 
 
 
1404 aa  301  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  35.84 
 
 
1441 aa  300  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  31.58 
 
 
1276 aa  299  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  38.12 
 
 
1276 aa  297  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  32.85 
 
 
1276 aa  296  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  34.82 
 
 
1463 aa  291  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  34.66 
 
 
1463 aa  288  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  32.49 
 
 
1451 aa  288  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  36.7 
 
 
1084 aa  268  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  31.89 
 
 
1206 aa  268  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  29.92 
 
 
1335 aa  255  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  31.91 
 
 
1489 aa  251  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  26.89 
 
 
1424 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  26.18 
 
 
1487 aa  242  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  30 
 
 
1500 aa  166  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  24.44 
 
 
1319 aa  159  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  28.5 
 
 
1396 aa  160  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  27.33 
 
 
1462 aa  147  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  29.62 
 
 
1398 aa  146  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  27.56 
 
 
1270 aa  144  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  27.63 
 
 
1395 aa  140  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  29.36 
 
 
1392 aa  139  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  33.7 
 
 
1937 aa  138  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  25 
 
 
1405 aa  137  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  28.04 
 
 
1406 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  25.04 
 
 
1448 aa  134  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  30.72 
 
 
1783 aa  128  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  26.02 
 
 
1550 aa  116  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  27.59 
 
 
1377 aa  94.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  24.89 
 
 
1401 aa  89  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  25.98 
 
 
1505 aa  83.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  28.01 
 
 
1434 aa  82.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  23.77 
 
 
1443 aa  79  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.38 
 
 
1359 aa  77.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  26.38 
 
 
1435 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  25.05 
 
 
1443 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  26.11 
 
 
1453 aa  73.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  24.34 
 
 
1056 aa  71.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  25 
 
 
1392 aa  69.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  25.28 
 
 
1346 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  27.14 
 
 
1347 aa  68.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  27.14 
 
 
1347 aa  68.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  27.14 
 
 
1347 aa  68.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  27.2 
 
 
1218 aa  68.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.02 
 
 
1243 aa  68.6  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.27 
 
 
1308 aa  67  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  26.02 
 
 
1358 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  26.02 
 
 
1360 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  26.49 
 
 
1360 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  24.45 
 
 
1375 aa  66.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.58 
 
 
1448 aa  65.9  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  26.89 
 
 
1292 aa  65.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  23.88 
 
 
1372 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  23.6 
 
 
1346 aa  64.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  23.88 
 
 
1372 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  23.88 
 
 
1372 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  23.88 
 
 
1372 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  23.88 
 
 
1372 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  23.88 
 
 
1372 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  23.88 
 
 
1372 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  24.72 
 
 
1184 aa  64.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  24.72 
 
 
1184 aa  64.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  22.42 
 
 
1226 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  23.1 
 
 
1378 aa  63.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  22.62 
 
 
1256 aa  61.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  24.59 
 
 
1304 aa  61.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  24.38 
 
 
1285 aa  60.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  24.95 
 
 
1453 aa  59.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  24.51 
 
 
1361 aa  59.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  31.4 
 
 
1426 aa  58.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  24.59 
 
 
1304 aa  58.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  22.97 
 
 
1224 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  22.38 
 
 
1025 aa  58.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  26.16 
 
 
1255 aa  58.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  24.71 
 
 
1299 aa  57.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  22.73 
 
 
1206 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  24.61 
 
 
1473 aa  57  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  24.57 
 
 
1705 aa  56.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  27.32 
 
 
1362 aa  55.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  22.73 
 
 
1224 aa  55.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  22.54 
 
 
1232 aa  55.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  23.13 
 
 
1332 aa  55.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  22.17 
 
 
1325 aa  55.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  24.21 
 
 
1380 aa  55.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  23.14 
 
 
1485 aa  54.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  23.51 
 
 
1226 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  22.52 
 
 
1223 aa  52.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>