More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0018 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  100 
 
 
287 aa  596  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  93.73 
 
 
287 aa  566  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  93.73 
 
 
287 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  74.19 
 
 
284 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  75.09 
 
 
290 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  74.19 
 
 
284 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  72.66 
 
 
284 aa  437  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  76.25 
 
 
265 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  61.4 
 
 
284 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  63.44 
 
 
288 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  62.5 
 
 
286 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  61.73 
 
 
280 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  62.86 
 
 
286 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  61.43 
 
 
284 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  62.11 
 
 
284 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  61.43 
 
 
284 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  61.13 
 
 
285 aa  362  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  62.55 
 
 
286 aa  359  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  62.5 
 
 
286 aa  359  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  62.37 
 
 
285 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  60.71 
 
 
286 aa  355  5e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  62.37 
 
 
285 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  62.37 
 
 
285 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  63.07 
 
 
287 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  58.87 
 
 
310 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  58.06 
 
 
288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  60.64 
 
 
287 aa  332  5e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  58.33 
 
 
293 aa  324  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  57.4 
 
 
286 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  57.19 
 
 
287 aa  312  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  53.24 
 
 
276 aa  312  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  57.2 
 
 
277 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  56.46 
 
 
300 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  54.87 
 
 
287 aa  309  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  53.87 
 
 
276 aa  308  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  52.52 
 
 
280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  56.09 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  53.6 
 
 
295 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4580  prephenate dehydratase  56.32 
 
 
282 aa  291  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  55.11 
 
 
288 aa  288  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  55.27 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  55.64 
 
 
299 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  52.16 
 
 
287 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  46.55 
 
 
288 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  53.73 
 
 
297 aa  258  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  47.97 
 
 
298 aa  241  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  40.07 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 
288 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  38.69 
 
 
280 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  39.85 
 
 
293 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  37.23 
 
 
280 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  41.39 
 
 
285 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  37.41 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  36.33 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  38.55 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  36.09 
 
 
304 aa  163  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.57 
 
 
358 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  30.66 
 
 
271 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  37.32 
 
 
276 aa  160  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  35.74 
 
 
279 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.2 
 
 
358 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.83 
 
 
358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.88 
 
 
385 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.45 
 
 
393 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.11 
 
 
386 aa  152  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  34.14 
 
 
399 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.81 
 
 
396 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  37.55 
 
 
277 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  35.64 
 
 
283 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.11 
 
 
385 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.11 
 
 
385 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.11 
 
 
385 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  34.31 
 
 
384 aa  148  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  32.17 
 
 
392 aa  148  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.97 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.11 
 
 
386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  33.09 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  32.61 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.11 
 
 
393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.41 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.41 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1303  prephenate dehydratase  32.73 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  36.16 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  36.75 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.12 
 
 
392 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  34.19 
 
 
371 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  34.19 
 
 
371 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.64 
 
 
355 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  35.71 
 
 
324 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  33.69 
 
 
315 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.99 
 
 
391 aa  142  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1513  Prephenate dehydratase  32.01 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.807541 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.41 
 
 
386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.41 
 
 
386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  34.41 
 
 
386 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  34.41 
 
 
386 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.41 
 
 
386 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.41 
 
 
386 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.41 
 
 
386 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.41 
 
 
386 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>