More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0003 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0001  chromosomal replication initiation protein  92.54 
 
 
496 aa  857  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00276825  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0001  chromosomal replication initiation protein  69.57 
 
 
516 aa  674  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  68.61 
 
 
479 aa  680  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  64.71 
 
 
524 aa  675  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  70.23 
 
 
524 aa  679  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  5.04678e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0001  chromosomal replication initiation protein  92.74 
 
 
496 aa  860  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  8.69739e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  70.69 
 
 
516 aa  675  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0002  chromosomal replication initiation protein  70.77 
 
 
481 aa  675  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480088  hitchhiker  1.32312e-05 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0003  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
520 aa  1058  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  2.73847e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  51.75 
 
 
473 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  51.46 
 
 
475 aa  466  1e-130  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  50.62 
 
 
475 aa  460  1e-128  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  51.55 
 
 
475 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  49.79 
 
 
472 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  50.41 
 
 
472 aa  453  1e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  49.07 
 
 
472 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  47.62 
 
 
498 aa  439  1e-122  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  45.91 
 
 
501 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  45.91 
 
 
501 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  46.61 
 
 
501 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  47.74 
 
 
510 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  2.44231e-08  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  47.01 
 
 
506 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0001  chromosomal replication initiation protein  47.8 
 
 
506 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0129481  hitchhiker  1.43408e-08 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  45.33 
 
 
494 aa  418  1e-115  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  46.22 
 
 
499 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.31 
 
 
519 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  1.18183e-08  unclonable  1.22456e-24 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  41.04 
 
 
448 aa  358  2e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  39.51 
 
 
482 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  40.94 
 
 
461 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  6.03983e-07 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  40.3 
 
 
455 aa  346  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  40.3 
 
 
455 aa  346  7e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  39.48 
 
 
460 aa  343  3e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  38.91 
 
 
470 aa  340  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 
464 aa  336  7e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  37.39 
 
 
452 aa  335  9e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  38 
 
 
477 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  38.52 
 
 
509 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  36.42 
 
 
460 aa  326  5e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.5 
 
 
477 aa  323  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  35.79 
 
 
475 aa  312  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.29 
 
 
446 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  35.61 
 
 
446 aa  309  8e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  35.61 
 
 
446 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  35.61 
 
 
446 aa  309  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  35.61 
 
 
446 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  35.61 
 
 
446 aa  309  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  35.61 
 
 
446 aa  308  1e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.61 
 
 
446 aa  308  1e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  36.42 
 
 
446 aa  308  2e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  36.38 
 
 
446 aa  305  1e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.97 
 
 
482 aa  305  1e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  4.60391e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 
446 aa  305  1e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.19 
 
 
453 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  34.79 
 
 
450 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  34.93 
 
 
450 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0001  chromosomal replication initiation protein  38.08 
 
 
487 aa  291  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.775334  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.93 
 
 
474 aa  288  1e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  34.79 
 
 
457 aa  283  4e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.23 
 
 
454 aa  283  5e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  33.75 
 
 
451 aa  283  6e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  34.71 
 
 
453 aa  282  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  34.71 
 
 
453 aa  282  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  34.58 
 
 
457 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.61 
 
 
446 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.83 
 
 
463 aa  281  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  33.06 
 
 
443 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  34.75 
 
 
442 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  33.75 
 
 
441 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.66 
 
 
449 aa  275  1e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  34.96 
 
 
452 aa  274  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  5.82235e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  33.19 
 
 
445 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.27 
 
 
461 aa  273  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  32.49 
 
 
436 aa  272  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  35.13 
 
 
462 aa  271  3e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.11976e-10  n/a   
 
 
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  34.48 
 
 
495 aa  269  9e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.85 
 
 
464 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  35.56 
 
 
445 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  33.62 
 
 
462 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  33.62 
 
 
462 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  33.62 
 
 
462 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  33.62 
 
 
462 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  35.96 
 
 
468 aa  267  3e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.52796e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.62 
 
 
469 aa  267  3e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.06 
 
 
483 aa  267  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 
440 aa  267  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  33.62 
 
 
460 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.86 
 
 
453 aa  266  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  33.62 
 
 
460 aa  266  6e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  34.44 
 
 
498 aa  266  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
460 aa  266  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  34.47 
 
 
466 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  34.47 
 
 
466 aa  266  9e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  34.47 
 
 
466 aa  266  9e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  35.28 
 
 
472 aa  266  9e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  34.47 
 
 
466 aa  266  9e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.57 
 
 
451 aa  266  9e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  32.57 
 
 
451 aa  266  9e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  34.47 
 
 
466 aa  266  9e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  33.62 
 
 
461 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.02323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.27 
 
 
516 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  3.522e-07  unclonable  7.22922e-12 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>