292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0002 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
88 aa  170  6e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  1.82845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  94.32 
 
 
88 aa  161  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  94.32 
 
 
105 aa  160  4e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  71.59 
 
 
88 aa  130  4e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  73.26 
 
 
87 aa  125  2e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.74442e-21 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  74.42 
 
 
92 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  74.42 
 
 
92 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  69.77 
 
 
88 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  75 
 
 
88 aa  119  1e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  8.69567e-05 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  77.27 
 
 
88 aa  119  1e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  70.45 
 
 
88 aa  119  1e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  69.32 
 
 
88 aa  118  2e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  69.32 
 
 
88 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  69.32 
 
 
88 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  67.05 
 
 
88 aa  117  4e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  67.05 
 
 
88 aa  115  2e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  68.18 
 
 
88 aa  114  4e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  73.86 
 
 
88 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  61.36 
 
 
88 aa  112  2e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 
89 aa  107  7e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0001  30S ribosomal protein S20  69.77 
 
 
87 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 
87 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  56.82 
 
 
88 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5079  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 
91 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 
88 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7874  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 
88 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3143  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4943  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 
88 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4039  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4212  30S ribosomal protein S20  61.36 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5323  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.761405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  56.82 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4886  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222256  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0001  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 
92 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000133909  decreased coverage  3.19383e-08 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  55.81 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1690  30S ribosomal protein S20  77.27 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000410806  hitchhiker  5.28048e-08 
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 
89 aa  90.5  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  51.14 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 
87 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3338  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 
86 aa  83.6  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
95 aa  77.8  5e-14  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.32 
 
 
88 aa  76.6  1e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
95 aa  75.9  2e-13  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
88 aa  73.9  6e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.96831e-11  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  47.73 
 
 
88 aa  73.2  1e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.03326e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  50.57 
 
 
87 aa  72  2e-12  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 
87 aa  72.4  2e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 
94 aa  71.6  3e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.34662e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
91 aa  71.6  4e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  5.03412e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 
88 aa  71.2  5e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  7.00681e-09  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 
109 aa  70.9  6e-12  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 
109 aa  70.9  6e-12  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 
88 aa  70.9  6e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.53205e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 
87 aa  70.5  8e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 
88 aa  70.1  1e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.22066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 
91 aa  69.7  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 
88 aa  70.1  1e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.11095e-08  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 
88 aa  70.1  1e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.0022e-08  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 
91 aa  69.7  1e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
88 aa  69.7  1e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
88 aa  69.3  2e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  44.19 
 
 
86 aa  68.9  2e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  2.07001e-09  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
90 aa  68.9  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
87 aa  68.6  3e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
87 aa  68.2  3e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  5.79115e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
87 aa  68.6  3e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
88 aa  68.6  3e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.73203e-15  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
87 aa  68.2  3e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.29038e-06  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
87 aa  68.2  3e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.49993e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 
88 aa  68.2  4e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
92 aa  67.8  4e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 
88 aa  68.2  4e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 
88 aa  67.8  5e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 
88 aa  67.8  5e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.04572e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 
88 aa  67.8  5e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.08096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 
88 aa  67.8  5e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.94185e-06  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  47.67 
 
 
86 aa  67.4  7e-11  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  44.19 
 
 
87 aa  67.4  7e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
92 aa  67  8e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
92 aa  67  8e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
92 aa  67  8e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
92 aa  67  8e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
91 aa  66.6  9e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
94 aa  66.6  1e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7573e-05 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
88 aa  66.6  1e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  65.9  2e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  65.9  2e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  47.67 
 
 
86 aa  65.9  2e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
87 aa  65.1  3e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31209e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 
92 aa  64.7  4e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 
88 aa  64.3  5e-10  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  64.3  6e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  63.2  1e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  63.2  1e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  63.2  1e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.25202e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2726  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 
88 aa  63.2  1e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.16732e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  63.2  1e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>