More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_9992 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009368  OSTLU_9992  Putative mitochondrial ribosomal protein S17  100 
 
 		 72 aa  144  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0440902  normal  0.0185342 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  48.57 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0068  30S ribosomal protein S17  48.61 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00143996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  44.93 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2072  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0741725  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1866  30S ribosomal protein S17  48.57 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  44.29 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1695  30S ribosomal protein S17  48.57 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  45.71 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1959  30S ribosomal protein S17  44.29 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.493665  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  45.71 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  47.22 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2160  30S ribosomal protein S17  45.71 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0103749  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0093  30S ribosomal protein S17  43.06 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.854  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0304  ribosomal protein S17  48.48 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000983019  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0295  30S ribosomal protein S17  45.71 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00357598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  40 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  44.29 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  44.29 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1768  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000123557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  47.14 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  44.29 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0043  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.183118  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1024  30S ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00110885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  44.29 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  37.14 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  44.29 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  34.72 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0274  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000911051  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1152  ribosomal protein S17  40 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000241067  hitchhiker  0.000026776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  37.14 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  44.93 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  45.31 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  38.57 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  43.94 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  37.14 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  43.94 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  43.94 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  37.14 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  40 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  43.94 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  44.29 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  43.94 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  45.31 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  45.71 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  42.42 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  40 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  38.57 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  45.31 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  43.94 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  42.03 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  38.57 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  42.42 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  42.86 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  42.42 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  42.42 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  37.14 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  42.86 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  42.42 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>