163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_9941 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_9941  predicted protein  100 
 
 		 73 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4126  50S ribosomal protein L28  58.9 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0615  50S ribosomal protein L28  63.01 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.149975  normal  0.298778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3337  50S ribosomal protein L28  63.01 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189365  normal  0.694787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2765  50S ribosomal protein L28  63.01 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2853  ribosomal protein L28  61.64 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09591  50S ribosomal protein L28  58.9 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0503954  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0898  50S ribosomal protein L28  58.9 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.512107  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09571  50S ribosomal protein L28  58.9 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.759768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0142  50S ribosomal protein L28  60.27 
 
 		 78 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0995678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09841  50S ribosomal protein L28  56.16 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.275607  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0042  50S ribosomal protein L28  60.27 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1605  50S ribosomal protein L28  57.53 
 
 		 78 aa  87  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15261  50S ribosomal protein L28  57.53 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.412029 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0305  50S ribosomal protein L28  53.42 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286615  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1405  50S ribosomal protein L28  56.16 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09781  50S ribosomal protein L28  53.42 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.299661 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1081  50S ribosomal protein L28  54.79 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08581  50S ribosomal protein L28  50.68 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122267 
 
 
-
 
NC_002950  PG1960  50S ribosomal protein L28  48.53 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3521  ribosomal protein L28  44.12 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36500  LSU ribosomal protein L28P  40.91 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13563  ribosomal protein L28  49.3 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0610  ribosomal protein L28  42.47 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.904571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3087  ribosomal protein L28  43.28 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280967  normal  0.0287054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3856  ribosomal protein L28  37.5 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000509188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4983  50S ribosomal protein L28  45.07 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0601  50S ribosomal protein L28  41.54 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.201453  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0021  ribosomal protein L28  43.59 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3372  50S ribosomal protein L28  36.76 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2021  ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2903  ribosomal protein L28  40 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.961047  normal  0.643497 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0570  hypothetical protein  42.03 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1606  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2589  50S ribosomal protein L28  44.78 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.155889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0544  50S ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.708685  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1743  50S ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4559  ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2139  50S ribosomal protein L28  44.93 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181781  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0582  50S ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0607  ribosomal protein L28  39.39 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2295  50S ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0544676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2670  50S ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2855  ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.621933  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6556  ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0648  50S ribosomal protein L28P  37.68 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1312  ribosomal protein L28  36.36 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3291  ribosomal protein L28  34.92 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2722  50S ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.238973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5365  50S ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3428  50S ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0550772  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3384  50S ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.237994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0707  50S ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.433692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70190  50S ribosomal protein L28  37.31 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0753  50S ribosomal protein L28  41.18 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.542713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5489  50S ribosomal protein L28  34.85 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234709  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1757  50S ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.991694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1117  50S ribosomal protein L28  39.71 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6092  50S ribosomal protein L28  37.31 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3567  ribosomal protein L28  37.68 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1468  ribosomal protein L28  32.81 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0159  ribosomal protein L28  36.23 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1995  ribosomal protein L28  32.31 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3723  50S ribosomal protein L28  34.92 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3149  50S ribosomal protein L28  40.3 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.65679 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0395  50S ribosomal protein L28  30.3 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.249784  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1790  50S ribosomal protein L28  30.3 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.588702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0629  50S ribosomal protein L28  35.94 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.865933  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5537  50S ribosomal protein L28  39.06 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0793752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3921  50S ribosomal protein L28  36.07 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3214  50S ribosomal protein L28  36.92 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5282  50S ribosomal protein L28  35.82 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0481  50S ribosomal protein L28  37.31 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5333  50S ribosomal protein L28  35.82 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1918  ribosomal protein L28  36.51 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0327  ribosomal protein L28  39.13 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0383291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3827  50S ribosomal protein L28  39.13 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.199336  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1282  50S ribosomal protein L28  40.3 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5192  50S ribosomal protein L28  35.82 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244386  normal  0.27276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0629  50S ribosomal protein L28  35.38 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000303775 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0546  50S ribosomal protein L28  37.31 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3951  50S ribosomal protein L28  35.82 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0325  ribosomal protein L28  37.31 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0089  ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0224  50S ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1710  50S ribosomal protein L28  37.31 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2139  ribosomal protein L28  40 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.476497  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3802  50S ribosomal protein L28  35.38 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1989  50S ribosomal protein L28  37.31 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48050  50S ribosomal protein L28  36.92 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4731  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4817  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0450945  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5116  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.478669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4374  50S ribosomal protein L28  36.92 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.335186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0589  50S ribosomal protein L28  35.82 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.74438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12095  50S ribosomal protein L28  37.88 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000776276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3143  50S ribosomal protein L28  35.38 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00769008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3596  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2641  50S ribosomal protein L28P  32.31 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3769  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326629  normal  0.774565 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>