More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_87146 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_87146  predicted protein  100 
 
 
480 aa  983    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000232549  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10557  ATP-dependent RNA helicase ded1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C2M6]  57.88 
 
 
668 aa  506  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07860  ATP-dependent RNA helicase ded1, putative  59.67 
 
 
637 aa  494  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_2097  predicted protein  57.08 
 
 
552 aa  490  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143499  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55603  ATP-dependent RNA helicase of DEAD box family  57.21 
 
 
616 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01240  p68-like protein, putative  44.03 
 
 
540 aa  347  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05931  ATP-dependent RNA helicase dbp2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0J9]  44.03 
 
 
563 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111979  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17862  predicted protein  42.01 
 
 
529 aa  329  6e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626563  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82821  DEAD box RNA helicase  43.35 
 
 
530 aa  320  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.283146  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36611  predicted protein  43.86 
 
 
452 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438813  decreased coverage  0.000242961 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27227  predicted protein  43.86 
 
 
452 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.689197 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1537  predicted protein  43.16 
 
 
394 aa  310  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.935265 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.22 
 
 
423 aa  299  8e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1743  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.39 
 
 
479 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.236928 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47095  predicted protein  45.01 
 
 
413 aa  294  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0903334  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.06 
 
 
498 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.33 
 
 
628 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.89 
 
 
441 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  44.04 
 
 
484 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.85 
 
 
567 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0874  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.67 
 
 
471 aa  286  5.999999999999999e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0145  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.38 
 
 
446 aa  286  7e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.32 
 
 
580 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  43.61 
 
 
622 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.78 
 
 
497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.44 
 
 
479 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.19 
 
 
599 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.89 
 
 
556 aa  282  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.26 
 
 
629 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0163  ATP-dependent RNA helicase  43.12 
 
 
446 aa  282  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.7 
 
 
508 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  43.26 
 
 
629 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.41 
 
 
489 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_1794  predicted protein  42.57 
 
 
421 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00327182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  39.91 
 
 
469 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.76 
 
 
527 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0198  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.71 
 
 
418 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  42.5 
 
 
557 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.71 
 
 
511 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  40.61 
 
 
527 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82655  ATP-dependent RNA helicase CA3 of the DEAD/DEAH box family  39.85 
 
 
526 aa  280  4e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.82 
 
 
497 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.98 
 
 
626 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01650  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 
615 aa  279  9e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.54 
 
 
482 aa  279  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.54 
 
 
522 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.86 
 
 
519 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  43.85 
 
 
510 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
519 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.46 
 
 
509 aa  279  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  44.02 
 
 
491 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.1 
 
 
482 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  41.78 
 
 
460 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.6 
 
 
465 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.22 
 
 
627 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.22 
 
 
626 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.94 
 
 
630 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.55 
 
 
473 aa  277  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  42.46 
 
 
520 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.46 
 
 
520 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.46 
 
 
520 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.71 
 
 
537 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.24 
 
 
448 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.23 
 
 
460 aa  276  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.26 
 
 
477 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  42.18 
 
 
559 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.18 
 
 
571 aa  275  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0074  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.56 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.63 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  42.47 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.18 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.47 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.1 
 
 
451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  42.25 
 
 
527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  42.47 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  42.47 
 
 
481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.72 
 
 
598 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  42.47 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12990  predicted protein  34.95 
 
 
500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.47 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.86 
 
 
471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0570  DNA/RNA helicase  43.47 
 
 
432 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1278000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.19 
 
 
545 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.66 
 
 
456 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  39.11 
 
 
492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.64 
 
 
493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.28 
 
 
493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 
559 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  44.1 
 
 
530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.1 
 
 
499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  43.13 
 
 
460 aa  274  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.72 
 
 
452 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.29 
 
 
487 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.19 
 
 
437 aa  274  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.98 
 
 
476 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01634  Pre-mRNA-splicing ATP-dependent RNA helicase prp28 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCU6]  37.44 
 
 
782 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  43.21 
 
 
540 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.63 
 
 
430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  43.14 
 
 
460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.66 
 
 
421 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>