More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_582 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009367  OSTLU_582  predicted protein  100 
 
 		 538 aa  1114    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000266967 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26775  predicted protein  41.05 
 
 		 593 aa  357  1.9999999999999998e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02350  SSD1 protein, putative  38.28 
 
 		 1671 aa  306  7e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23306  predicted protein  39.29 
 
 		 908 aa  294  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103886  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03657  putative TeaA receptor TeaR (Eurofung)  35.62 
 
 		 1015 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.902934 
 
 
-
 
NC_006686  CND00800  conserved hypothetical protein  36.8 
 
 		 1002 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.123934  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  36.33 
 
 		 735 aa  283  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43971  predicted protein  34.07 
 
 		 962 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_10027  predicted protein  35.48 
 
 		 668 aa  273  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000299968  normal  0.0425653 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86849  3'-5' exoribonuclease required for 3 end formation of 5.8S rRNA  36.46 
 
 		 989 aa  271  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  33.74 
 
 		 742 aa  254  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  34.63 
 
 		 726 aa  253  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  33.95 
 
 		 709 aa  252  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  35.68 
 
 		 762 aa  240  5e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  34.47 
 
 		 705 aa  239  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  33.66 
 
 		 791 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  34.46 
 
 		 791 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  33.49 
 
 		 794 aa  238  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  34.03 
 
 		 795 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  35.57 
 
 		 795 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  34.68 
 
 		 825 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  36.84 
 
 		 750 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  34.28 
 
 		 770 aa  232  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  35.5 
 
 		 718 aa  230  5e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  32.31 
 
 		 795 aa  229  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  34.55 
 
 		 702 aa  223  7e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01158  cell wall biogenesis protein phosphatase Ssd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11420)  33.13 
 
 		 1374 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  32.49 
 
 		 751 aa  213  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  31.32 
 
 		 716 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  30.49 
 
 		 788 aa  211  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  30.5 
 
 		 863 aa  205  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  29.37 
 
 		 709 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  31.75 
 
 		 813 aa  203  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  31.59 
 
 		 759 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  32.86 
 
 		 801 aa  201  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  30.53 
 
 		 737 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  34.7 
 
 		 763 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  29.89 
 
 		 827 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  28.97 
 
 		 762 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  34.43 
 
 		 777 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  30.83 
 
 		 751 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  30.83 
 
 		 751 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  34.16 
 
 		 720 aa  196  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  32.08 
 
 		 806 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  31.93 
 
 		 801 aa  195  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  30.13 
 
 		 903 aa  195  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  31.07 
 
 		 806 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  34.08 
 
 		 810 aa  192  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.59 
 
 		 670 aa  192  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  30.11 
 
 		 766 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  30.6 
 
 		 704 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  31.44 
 
 		 808 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  31.44 
 
 		 804 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  31.44 
 
 		 808 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  30.61 
 
 		 806 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  30.61 
 
 		 808 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  30.61 
 
 		 810 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  30.61 
 
 		 812 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  33.7 
 
 		 814 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  30.26 
 
 		 758 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  30.02 
 
 		 842 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  31.13 
 
 		 667 aa  189  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  29.83 
 
 		 770 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  30.3 
 
 		 758 aa  189  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  31.28 
 
 		 792 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  29.34 
 
 		 757 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  32.59 
 
 		 722 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  32.27 
 
 		 705 aa  186  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3785  ribonuclease R  27.22 
 
 		 748 aa  186  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  28.06 
 
 		 706 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  34.08 
 
 		 817 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  34.64 
 
 		 710 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  29.34 
 
 		 1182 aa  183  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  35.18 
 
 		 710 aa  183  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  29.57 
 
 		 805 aa  183  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  30.1 
 
 		 770 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2449  ribonuclease R  30.97 
 
 		 808 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.162395  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09080  VacB/RNase II-like 3'-5' exoribonuclease  33.81 
 
 		 670 aa  182  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  29.59 
 
 		 695 aa  180  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2853  ribonuclease R  30.44 
 
 		 754 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0915  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  33.58 
 
 		 756 aa  180  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  28.67 
 
 		 829 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  29.06 
 
 		 808 aa  180  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  31.7 
 
 		 665 aa  179  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  28.87 
 
 		 706 aa  179  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  33.52 
 
 		 715 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  30.86 
 
 		 876 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  30.34 
 
 		 870 aa  178  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  33.1 
 
 		 763 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  29.69 
 
 		 752 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  28.92 
 
 		 834 aa  177  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  29.93 
 
 		 770 aa  177  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  29.9 
 
 		 810 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  27.22 
 
 		 821 aa  177  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  32.77 
 
 		 716 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  30.62 
 
 		 771 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  30.46 
 
 		 895 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  28.72 
 
 		 804 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1983  exoribonuclease II  30.94 
 
 		 744 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944364 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  31.34 
 
 		 779 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>