More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_50379 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  44.63 
 
 
1073 aa  809    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  44.92 
 
 
1068 aa  838    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  44.69 
 
 
998 aa  805    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  43.71 
 
 
933 aa  764    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  43.56 
 
 
1068 aa  830    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  100 
 
 
1023 aa  2109    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  34.84 
 
 
1239 aa  554  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  43.99 
 
 
1185 aa  436  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  43.37 
 
 
872 aa  426  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  41.1 
 
 
1175 aa  392  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.15 
 
 
952 aa  357  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  30.63 
 
 
918 aa  348  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  30.7 
 
 
906 aa  346  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  30.44 
 
 
904 aa  343  9e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.6 
 
 
931 aa  342  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.32 
 
 
947 aa  342  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  30.31 
 
 
893 aa  340  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  30.78 
 
 
889 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  29.87 
 
 
953 aa  335  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.06 
 
 
996 aa  333  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.42 
 
 
964 aa  332  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  30.36 
 
 
972 aa  332  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.16 
 
 
933 aa  329  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  31.15 
 
 
916 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.69 
 
 
950 aa  327  5e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.85 
 
 
984 aa  325  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  29.29 
 
 
909 aa  321  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  28.36 
 
 
908 aa  317  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.49 
 
 
919 aa  317  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  29.07 
 
 
924 aa  314  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  36.14 
 
 
919 aa  312  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  35.61 
 
 
994 aa  312  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  29.05 
 
 
936 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  28.51 
 
 
906 aa  310  8e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  28.22 
 
 
908 aa  310  9e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.55 
 
 
981 aa  309  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  37.43 
 
 
952 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.07 
 
 
929 aa  306  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  28.71 
 
 
926 aa  305  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  32.01 
 
 
1293 aa  303  9e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.03 
 
 
951 aa  302  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.09 
 
 
917 aa  301  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.54 
 
 
918 aa  300  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.54 
 
 
918 aa  300  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  34.41 
 
 
877 aa  298  3e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.54 
 
 
918 aa  298  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  34.67 
 
 
924 aa  298  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.12 
 
 
815 aa  297  9e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  37.76 
 
 
924 aa  296  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  35.96 
 
 
905 aa  293  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  36.81 
 
 
927 aa  293  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.61 
 
 
927 aa  291  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.62 
 
 
921 aa  291  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  33.92 
 
 
908 aa  291  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  33.04 
 
 
908 aa  290  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  34.59 
 
 
863 aa  288  4e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  36.15 
 
 
1055 aa  284  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.06 
 
 
762 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.77 
 
 
932 aa  277  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  31.28 
 
 
967 aa  277  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  31.28 
 
 
967 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  31.99 
 
 
1003 aa  263  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.25 
 
 
709 aa  222  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 
843 aa  214  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  48.79 
 
 
890 aa  192  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.56 
 
 
990 aa  191  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  51.03 
 
 
1026 aa  190  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.17 
 
 
950 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  48.04 
 
 
961 aa  179  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
922 aa  177  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  50 
 
 
935 aa  177  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.74 
 
 
424 aa  168  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.53 
 
 
951 aa  149  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  39.15 
 
 
940 aa  146  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  43.28 
 
 
1209 aa  138  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.62 
 
 
700 aa  131  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  27.67 
 
 
824 aa  126  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.78 
 
 
817 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.23 
 
 
707 aa  119  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.23 
 
 
707 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.48 
 
 
1004 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35 
 
 
845 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.15 
 
 
756 aa  112  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2083  DSH domain protein  35.27 
 
 
516 aa  111  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00750043  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.15 
 
 
950 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  30.8 
 
 
861 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.22 
 
 
861 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.8 
 
 
868 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.22 
 
 
861 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.5 
 
 
876 aa  108  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.26 
 
 
870 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.37 
 
 
747 aa  105  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.37 
 
 
746 aa  105  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.8 
 
 
852 aa  105  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.8 
 
 
852 aa  105  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.8 
 
 
852 aa  105  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  30.36 
 
 
869 aa  105  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.53 
 
 
851 aa  105  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  28.7 
 
 
885 aa  104  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.36 
 
 
1231 aa  104  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>