51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_45407 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  100 
 
 
938 aa  1913    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  29.4 
 
 
1701 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  27.97 
 
 
1742 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  27.15 
 
 
1546 aa  225  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  26.25 
 
 
2028 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  25.43 
 
 
2110 aa  134  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  27.97 
 
 
256 aa  104  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  22.26 
 
 
2206 aa  102  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  25.94 
 
 
281 aa  94  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  27.56 
 
 
328 aa  94  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  25.61 
 
 
274 aa  94  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  25.7 
 
 
282 aa  90.5  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  29.66 
 
 
288 aa  89.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  24.75 
 
 
315 aa  89.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  25.32 
 
 
291 aa  89  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  27.17 
 
 
276 aa  89  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  25.87 
 
 
274 aa  87  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  26.12 
 
 
278 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  29.64 
 
 
290 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  27.08 
 
 
276 aa  85.9  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  27.69 
 
 
274 aa  82.8  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  27.47 
 
 
271 aa  82.8  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  29.53 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  28.03 
 
 
258 aa  80.5  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  30.2 
 
 
268 aa  79.7  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  22.07 
 
 
1012 aa  79.3  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  27.08 
 
 
282 aa  79  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  25.74 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  22.55 
 
 
274 aa  77.4  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  25.54 
 
 
304 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  25.08 
 
 
300 aa  76.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  26.18 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  25.59 
 
 
262 aa  72  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  27.78 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  29.66 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  26.62 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  26.59 
 
 
269 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  31.84 
 
 
277 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  26.56 
 
 
261 aa  67.4  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  28.57 
 
 
282 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  19.85 
 
 
533 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  29.29 
 
 
261 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  24.18 
 
 
290 aa  65.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  28.74 
 
 
292 aa  65.1  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  25 
 
 
280 aa  62  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  25.69 
 
 
718 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  26.56 
 
 
289 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  25.53 
 
 
272 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  23.41 
 
 
280 aa  58.9  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  27.31 
 
 
277 aa  56.2  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  27.14 
 
 
469 aa  51.6  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>