248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_443 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  54.49 
 
 
1077 aa  901    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  55.45 
 
 
1090 aa  937    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  100 
 
 
797 aa  1660    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  37.83 
 
 
466 aa  268  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  32.32 
 
 
655 aa  251  5e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  35.27 
 
 
952 aa  247  6.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  37.53 
 
 
479 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  31.41 
 
 
754 aa  243  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  32.61 
 
 
635 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  33.83 
 
 
622 aa  227  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  33.26 
 
 
619 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  33.49 
 
 
651 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  32.68 
 
 
636 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  33.19 
 
 
622 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  32.5 
 
 
636 aa  222  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  32.04 
 
 
611 aa  218  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  35.16 
 
 
388 aa  217  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  34.58 
 
 
632 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  34.62 
 
 
686 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  30.31 
 
 
716 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  32.02 
 
 
643 aa  207  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  45.79 
 
 
268 aa  205  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  32.42 
 
 
2245 aa  197  8.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  31.03 
 
 
1999 aa  197  9e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  32.03 
 
 
609 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  31.2 
 
 
650 aa  194  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  30.47 
 
 
464 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  31 
 
 
650 aa  191  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  28.57 
 
 
795 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  29.96 
 
 
633 aa  187  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  28.98 
 
 
633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  28.41 
 
 
633 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  31.67 
 
 
715 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  27.73 
 
 
633 aa  178  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  29.14 
 
 
748 aa  177  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  31.66 
 
 
1038 aa  170  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  31.65 
 
 
902 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  31.47 
 
 
934 aa  163  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.13 
 
 
1048 aa  160  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  30 
 
 
629 aa  160  8e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  29.91 
 
 
1097 aa  157  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28.64 
 
 
986 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  31.26 
 
 
553 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  31.26 
 
 
553 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  32.79 
 
 
315 aa  151  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  32.29 
 
 
1189 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  29.62 
 
 
606 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.97 
 
 
752 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.85 
 
 
1099 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.54 
 
 
902 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.97 
 
 
521 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.98 
 
 
901 aa  134  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  30.92 
 
 
297 aa  128  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  28.12 
 
 
486 aa  126  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  28.21 
 
 
759 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  27.99 
 
 
759 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  27.99 
 
 
759 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  27.99 
 
 
759 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  28.14 
 
 
759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  27.56 
 
 
759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  27.62 
 
 
759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  28.42 
 
 
1653 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  29.67 
 
 
941 aa  121  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  27.1 
 
 
769 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  27.41 
 
 
759 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  27.99 
 
 
759 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  25.73 
 
 
585 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.6 
 
 
769 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.48 
 
 
2310 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  27.12 
 
 
1651 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  29.18 
 
 
1585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  29.18 
 
 
1585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.82 
 
 
1018 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  32.41 
 
 
237 aa  114  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  28.32 
 
 
1427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  28.97 
 
 
1108 aa  112  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  27.17 
 
 
1408 aa  104  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  27.76 
 
 
944 aa  104  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  23.1 
 
 
1137 aa  103  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.47 
 
 
1116 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  24.71 
 
 
1190 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  25.05 
 
 
1111 aa  98.6  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.67 
 
 
1126 aa  98.6  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  30.49 
 
 
219 aa  96.3  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.86 
 
 
1620 aa  96.3  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  28.34 
 
 
283 aa  95.1  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  28.62 
 
 
1422 aa  95.1  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  27.27 
 
 
1118 aa  93.6  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.4 
 
 
1428 aa  92.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  29.02 
 
 
1284 aa  91.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  25.52 
 
 
1250 aa  90.9  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  25.75 
 
 
1284 aa  87.8  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  24.52 
 
 
1261 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.07 
 
 
254 aa  85.9  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  25.06 
 
 
1172 aa  85.9  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  26 
 
 
1198 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  23.6 
 
 
1427 aa  82.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  25.3 
 
 
1350 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.34 
 
 
1126 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.31 
 
 
1203 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>