More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43996 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_43996  ABC(ABCD) family transporter: long-chain fatty acid (ALDP-like protein)  100 
 
 
615 aa  1253    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.4859  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_10028  ABC(ABCD) family transporter: long-chain fatty acid  39.36 
 
 
583 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.98374  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01014  peroxisomal fatty acid ABC transporter, putative (Eurofung)  33.44 
 
 
706 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186726 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03860  adrenoleukodystrophy protein, putative  31.98 
 
 
725 aa  281  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06310  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  32.82 
 
 
867 aa  263  8e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10078  peroxisomal fatty acid ABC transporter, putative (Eurofung)  33.82 
 
 
820 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252374  normal  0.955787 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30885  predicted protein  28.38 
 
 
806 aa  234  4.0000000000000004e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0333554  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82035  Peroxisomal long-chain fatty acid import protein 1 (Peroxisomal ABC transporter 2)  30.48 
 
 
689 aa  228  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.670256  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  27.68 
 
 
660 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  30.46 
 
 
667 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  29.27 
 
 
534 aa  204  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 
660 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  30.28 
 
 
567 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  27.88 
 
 
660 aa  200  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  27.29 
 
 
660 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  31.43 
 
 
663 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  28.49 
 
 
611 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  31.43 
 
 
663 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  29.23 
 
 
667 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  29.96 
 
 
603 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  30.21 
 
 
570 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  29.49 
 
 
668 aa  187  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  29.47 
 
 
662 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  27.61 
 
 
662 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  27.43 
 
 
662 aa  184  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  27.92 
 
 
589 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  29.55 
 
 
575 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  28.76 
 
 
576 aa  180  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  28.37 
 
 
669 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  27.93 
 
 
563 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  28.69 
 
 
605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  29.31 
 
 
665 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  27.73 
 
 
658 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  29.88 
 
 
606 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.16 
 
 
598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  30.26 
 
 
602 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  26.55 
 
 
590 aa  167  8e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  30.39 
 
 
626 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  30.18 
 
 
596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  28.16 
 
 
576 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  28.46 
 
 
639 aa  164  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  29.7 
 
 
596 aa  164  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.48 
 
 
549 aa  163  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  28.16 
 
 
608 aa  163  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  30 
 
 
615 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  27.92 
 
 
712 aa  161  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  28.06 
 
 
630 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  30.1 
 
 
579 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  27.61 
 
 
708 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  29.1 
 
 
635 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  28.62 
 
 
637 aa  156  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  29.45 
 
 
633 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  28.91 
 
 
701 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  28.73 
 
 
595 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  29.46 
 
 
603 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  27.15 
 
 
575 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.47 
 
 
587 aa  152  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  30.37 
 
 
626 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  27.47 
 
 
587 aa  152  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  27.88 
 
 
599 aa  151  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  27.98 
 
 
583 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  28.07 
 
 
704 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  29.2 
 
 
613 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  28.09 
 
 
597 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  28.19 
 
 
586 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  44.27 
 
 
640 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  26.8 
 
 
578 aa  147  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  27.24 
 
 
621 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  29.28 
 
 
713 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  29.9 
 
 
632 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  27.31 
 
 
588 aa  143  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  26.85 
 
 
636 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  26.53 
 
 
614 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  26.85 
 
 
634 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  28.73 
 
 
704 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  26.85 
 
 
636 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  26.47 
 
 
593 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  26.34 
 
 
614 aa  140  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  28.73 
 
 
712 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  28.2 
 
 
606 aa  140  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  27.24 
 
 
577 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  28.08 
 
 
670 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  28.08 
 
 
670 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  27.61 
 
 
610 aa  137  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  25.99 
 
 
674 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  27.1 
 
 
614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  28.32 
 
 
595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  25.77 
 
 
636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  27.04 
 
 
592 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  25.55 
 
 
600 aa  133  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  27.04 
 
 
583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.19 
 
 
588 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  27.29 
 
 
591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  26.19 
 
 
588 aa  132  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  26.19 
 
 
588 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.19 
 
 
584 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  28.27 
 
 
666 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  26.19 
 
 
588 aa  132  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.19 
 
 
588 aa  132  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  28.95 
 
 
563 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>