241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42380 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  100 
 
 
479 aa  985    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  48.08 
 
 
388 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  40.88 
 
 
466 aa  295  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  48.39 
 
 
268 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  38.87 
 
 
1090 aa  249  7e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  38.97 
 
 
1077 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  37.53 
 
 
797 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  34.83 
 
 
952 aa  240  5e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  39.31 
 
 
2245 aa  216  5e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  33.33 
 
 
609 aa  203  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  37.87 
 
 
754 aa  199  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  36.16 
 
 
1999 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  34.52 
 
 
619 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  33.73 
 
 
622 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  34.45 
 
 
651 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  35.93 
 
 
655 aa  190  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  33.49 
 
 
622 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  35.36 
 
 
643 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  37.42 
 
 
650 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  37.11 
 
 
650 aa  179  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  35.96 
 
 
633 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  34.08 
 
 
1189 aa  176  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  35.02 
 
 
633 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  35.88 
 
 
633 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  35.03 
 
 
633 aa  170  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  31.17 
 
 
636 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  34.1 
 
 
795 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  29.12 
 
 
748 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  32 
 
 
636 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.01 
 
 
635 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  32.49 
 
 
632 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  35.45 
 
 
934 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  36.84 
 
 
553 aa  159  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  36.84 
 
 
553 aa  159  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  33.68 
 
 
986 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  33.13 
 
 
464 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  31.39 
 
 
686 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  34.55 
 
 
902 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  28.81 
 
 
715 aa  149  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  33.07 
 
 
902 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  35.86 
 
 
315 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  30 
 
 
716 aa  147  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  27.93 
 
 
611 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.49 
 
 
1048 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.72 
 
 
752 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  32.69 
 
 
941 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.1 
 
 
629 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  33.79 
 
 
901 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  33.33 
 
 
1018 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  28.4 
 
 
1097 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  30.4 
 
 
521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.46 
 
 
1099 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  32.47 
 
 
1653 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  29.31 
 
 
486 aa  123  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
2310 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  30.32 
 
 
1038 aa  120  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.82 
 
 
606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  28.57 
 
 
585 aa  113  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  29.81 
 
 
1585 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  29.81 
 
 
1585 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  28.61 
 
 
1108 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  27.65 
 
 
1190 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  28.62 
 
 
1620 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  28.66 
 
 
297 aa  97.4  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  28.03 
 
 
1651 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  27.74 
 
 
1427 aa  94  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  30.36 
 
 
944 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  28.57 
 
 
283 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  25 
 
 
1284 aa  90.5  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  28.06 
 
 
1041 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  29.33 
 
 
237 aa  87.4  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  25.95 
 
 
1111 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  32.53 
 
 
1973 aa  86.7  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  26.76 
 
 
1422 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  26.92 
 
 
759 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  25.89 
 
 
1126 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  27.19 
 
 
759 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  26.92 
 
 
759 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  26.46 
 
 
1854 aa  84  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.63 
 
 
759 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.43 
 
 
1428 aa  84  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  41.03 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  26.33 
 
 
759 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  26.9 
 
 
769 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.5 
 
 
759 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  26.04 
 
 
759 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  26.04 
 
 
759 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  26.04 
 
 
759 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  27.15 
 
 
922 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  27.25 
 
 
769 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 
1203 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.8 
 
 
916 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  25.7 
 
 
1593 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  28.62 
 
 
1754 aa  80.1  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  32.84 
 
 
1175 aa  79.7  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  24.79 
 
 
1151 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25 
 
 
1116 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  29.15 
 
 
1212 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  26.69 
 
 
1408 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33296  predicted protein  32.95 
 
 
634 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>