30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42302 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  100 
 
 
622 aa  1280    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  35.96 
 
 
1277 aa  390  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  32.81 
 
 
934 aa  323  5e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  29.7 
 
 
895 aa  292  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00910  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  35 
 
 
932 aa  266  5.999999999999999e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.752282  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  24.66 
 
 
630 aa  128  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  23.4 
 
 
939 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  21.96 
 
 
854 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  23.41 
 
 
839 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  22.94 
 
 
829 aa  114  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07016  AP-2 adaptor complex subunit alpha, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04310)  20.88 
 
 
935 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  23.42 
 
 
812 aa  111  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  21.3 
 
 
450 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_278  predicted protein  21.21 
 
 
971 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.385886 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48152  predicted protein  21.21 
 
 
979 aa  104  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0169632 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  19.57 
 
 
1063 aa  93.2  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54442  predicted protein  23.64 
 
 
1019 aa  80.9  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.595032  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  22.18 
 
 
766 aa  77  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32574  predicted protein  22.14 
 
 
981 aa  74.3  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  22.43 
 
 
551 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  21.75 
 
 
755 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  22.18 
 
 
732 aa  69.7  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  21.49 
 
 
696 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  23.22 
 
 
936 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  19.4 
 
 
717 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  19.19 
 
 
947 aa  48.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2118  HEAT domain containing protein  24.17 
 
 
380 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  18.97 
 
 
736 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  22.29 
 
 
835 aa  44.3  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  21.69 
 
 
805 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>