88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42228 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  100 
 
 
460 aa  950    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  60.46 
 
 
391 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  52.67 
 
 
376 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  52.42 
 
 
376 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  43.93 
 
 
398 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  43 
 
 
377 aa  297  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  43.37 
 
 
379 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  40.77 
 
 
783 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  42.89 
 
 
390 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  41.28 
 
 
814 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  41.13 
 
 
393 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  41.54 
 
 
783 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  41.35 
 
 
399 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  40.21 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  39.44 
 
 
373 aa  270  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  40.36 
 
 
363 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  41.98 
 
 
389 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  41.49 
 
 
369 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  40.71 
 
 
381 aa  264  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  41.12 
 
 
395 aa  264  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.74 
 
 
372 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  40.46 
 
 
383 aa  262  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  40.91 
 
 
415 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  39.32 
 
 
364 aa  259  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  39.46 
 
 
395 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  39.55 
 
 
395 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  40.56 
 
 
394 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  38.99 
 
 
395 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  38.63 
 
 
386 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  40.25 
 
 
395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  40.92 
 
 
395 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  38.73 
 
 
409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  39.42 
 
 
402 aa  253  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  37.44 
 
 
391 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  40.62 
 
 
370 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  39.23 
 
 
399 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  39.06 
 
 
428 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  39.23 
 
 
399 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  41.92 
 
 
375 aa  247  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  38.48 
 
 
383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  39.07 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  38.99 
 
 
373 aa  243  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  38.06 
 
 
382 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  39.27 
 
 
413 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  37.97 
 
 
395 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  38.56 
 
 
425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  38.4 
 
 
372 aa  239  6.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  39.8 
 
 
370 aa  239  8e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  38.54 
 
 
386 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  38.73 
 
 
399 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  37.66 
 
 
365 aa  237  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  38.36 
 
 
370 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  36.3 
 
 
413 aa  236  9e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  35.86 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  39.14 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  37.31 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  37.11 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  37.4 
 
 
367 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  36.9 
 
 
367 aa  229  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  35.66 
 
 
380 aa  229  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  37.02 
 
 
384 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  36.68 
 
 
381 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  36.08 
 
 
372 aa  223  4e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  34.42 
 
 
391 aa  217  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  37.69 
 
 
371 aa  216  8e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  37.14 
 
 
367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  36.36 
 
 
381 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  35.14 
 
 
383 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  35.58 
 
 
383 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  33.42 
 
 
396 aa  211  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  34.88 
 
 
383 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  36.29 
 
 
381 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  34.24 
 
 
391 aa  209  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  35.09 
 
 
383 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  34.88 
 
 
383 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  34.48 
 
 
400 aa  204  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  36.64 
 
 
369 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  31.14 
 
 
404 aa  180  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  22.41 
 
 
394 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  23.44 
 
 
369 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
547 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  51.06 
 
 
245 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  53.19 
 
 
484 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  37.7 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  50 
 
 
476 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.08 
 
 
562 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544058  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  30.39 
 
 
496 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  29.17 
 
 
511 aa  43.9  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>