50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_4102 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  100 
 
 
241 aa  502  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  unclonable  1.87913e-05 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  27.51 
 
 
821 aa  65.5  7e-10  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47504  predicted protein  22.71 
 
 
812 aa  55.8  5e-07  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.52 
 
 
344 aa  52.4  6e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  60.53 
 
 
262 aa  51.6  1e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.65 
 
 
424 aa  50.4  2e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.64 
 
 
365 aa  49.7  4e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  51.22 
 
 
514 aa  49.7  4e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
618 aa  49.7  4e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  68.97 
 
 
453 aa  49.3  6e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  31.33 
 
 
342 aa  48.9  7e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  34.52 
 
 
365 aa  48.9  7e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  34.12 
 
 
344 aa  48.9  8e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.22 
 
 
500 aa  48.9  8e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  34.12 
 
 
344 aa  48.5  9e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  20.24 
 
 
337 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.63 
 
 
606 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.63 
 
 
606 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  34.52 
 
 
365 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
506 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.16 
 
 
497 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  33.33 
 
 
1247 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  32.56 
 
 
343 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  30.86 
 
 
392 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  28.92 
 
 
346 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  33.73 
 
 
340 aa  45.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  28.92 
 
 
341 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  34.52 
 
 
356 aa  45.4  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  75 
 
 
237 aa  45.4  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.53 
 
 
378 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  28.92 
 
 
342 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  28.92 
 
 
342 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  28.92 
 
 
341 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  28.92 
 
 
342 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  28.92 
 
 
342 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  32.91 
 
 
840 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  50 
 
 
375 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  29.63 
 
 
365 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.38 
 
 
446 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  30.12 
 
 
340 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.63 
 
 
615 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  30.59 
 
 
340 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  71.43 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.63 
 
 
375 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  43.86 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  67.86 
 
 
256 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  29.41 
 
 
363 aa  42  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  67.86 
 
 
239 aa  42  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.93 
 
 
218 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  67.86 
 
 
256 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>