18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39384 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50048  predicted protein  45.24 
 
 		 225 aa  84.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  37.21 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68190  predicted protein  32.61 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  42.47 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  47.14 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10752  predicted protein  39.44 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  44.29 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  42.62 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  42.86 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05400  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm8, putative  33.77 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  41.43 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  43.48 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  38.1 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  37.84 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  32.86 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  38.33 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  35.06 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>