141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_37994 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  100 
 
 
521 aa  1066    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  33.79 
 
 
1038 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  28.69 
 
 
1077 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  33.44 
 
 
297 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  27.45 
 
 
1090 aa  144  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  27.97 
 
 
797 aa  140  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  30.4 
 
 
479 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  28.51 
 
 
635 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  28.34 
 
 
636 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  33.44 
 
 
315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  28.51 
 
 
611 aa  126  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  29.4 
 
 
986 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  27.37 
 
 
636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  29.1 
 
 
609 aa  113  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  32.89 
 
 
632 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  28.9 
 
 
388 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  29.72 
 
 
650 aa  110  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  24.7 
 
 
633 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.47 
 
 
633 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  23.23 
 
 
655 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  29.41 
 
 
650 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  26.49 
 
 
466 aa  106  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.22 
 
 
752 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  30 
 
 
754 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  31.72 
 
 
795 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  24.79 
 
 
633 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  26.02 
 
 
643 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29.59 
 
 
2245 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  26.52 
 
 
1999 aa  98.6  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  27.83 
 
 
585 aa  98.2  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  27.56 
 
 
902 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  26.57 
 
 
633 aa  96.3  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25.1 
 
 
952 aa  95.9  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.9 
 
 
622 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  27.47 
 
 
622 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.82 
 
 
902 aa  94.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.04 
 
 
619 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.15 
 
 
934 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  31.01 
 
 
651 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  34.2 
 
 
1082 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  27.83 
 
 
901 aa  87.8  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  28.94 
 
 
464 aa  87.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  25.56 
 
 
715 aa  87  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  25.69 
 
 
686 aa  86.7  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.84 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  28.97 
 
 
1228 aa  84.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.61 
 
 
629 aa  84  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  26.18 
 
 
1048 aa  83.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  26.47 
 
 
1172 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  28.47 
 
 
716 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  29.01 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  29.01 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.21 
 
 
1189 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.29 
 
 
606 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  27.59 
 
 
1139 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  28.83 
 
 
1116 aa  80.5  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  25.05 
 
 
1097 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  26.17 
 
 
748 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  35.38 
 
 
1143 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  35.38 
 
 
1143 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  27.19 
 
 
1126 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  34.36 
 
 
1143 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  29.37 
 
 
1151 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  25.55 
 
 
1250 aa  76.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  29.43 
 
 
1585 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  27.16 
 
 
1163 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  29.43 
 
 
1585 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.88 
 
 
1099 aa  75.1  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  27.69 
 
 
659 aa  75.5  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.3 
 
 
1126 aa  73.9  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  26.98 
 
 
1118 aa  73.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  27.48 
 
 
268 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  27.2 
 
 
1350 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  26.46 
 
 
1653 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  27.53 
 
 
944 aa  70.5  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  28.78 
 
 
1153 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  24.46 
 
 
1261 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  28.34 
 
 
1620 aa  68.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  23.68 
 
 
2310 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  27.3 
 
 
1651 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.88 
 
 
1324 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  25.18 
 
 
1247 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  26.4 
 
 
1215 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  27.78 
 
 
1196 aa  65.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  28.32 
 
 
1280 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  25.34 
 
 
905 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  25.34 
 
 
905 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.31 
 
 
254 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  29.06 
 
 
1215 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  24.65 
 
 
1108 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  34.31 
 
 
219 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  24.66 
 
 
907 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.3 
 
 
932 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  24.66 
 
 
900 aa  62  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  27.41 
 
 
941 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  23.55 
 
 
905 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  24.32 
 
 
905 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  25.09 
 
 
908 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  25.08 
 
 
1427 aa  61.2  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  24.32 
 
 
905 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>