106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34480 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  51.37 
 
 		 818 aa  722    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  47.74 
 
 		 866 aa  699    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  53.1 
 
 		 838 aa  769    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  100 
 
 		 781 aa  1632    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  51.52 
 
 		 720 aa  716    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.62 
 
 		 558 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  31.45 
 
 		 549 aa  276  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  32.96 
 
 		 602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  32.14 
 
 		 554 aa  273  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  30.51 
 
 		 558 aa  273  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  31.7 
 
 		 558 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  31.74 
 
 		 551 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.11 
 
 		 550 aa  269  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  31.97 
 
 		 551 aa  268  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  32.39 
 
 		 548 aa  267  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  32.39 
 
 		 557 aa  265  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  31.28 
 
 		 559 aa  264  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  32.28 
 
 		 548 aa  264  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  31.69 
 
 		 548 aa  264  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  31.05 
 
 		 561 aa  263  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  32.17 
 
 		 556 aa  260  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  32.16 
 
 		 548 aa  260  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  30.72 
 
 		 548 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  31.8 
 
 		 550 aa  258  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  31.95 
 
 		 546 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  31.35 
 
 		 590 aa  253  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  31.02 
 
 		 545 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  31.35 
 
 		 548 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  30.98 
 
 		 549 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  30.98 
 
 		 549 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  30.98 
 
 		 549 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  31.83 
 
 		 549 aa  251  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  30.78 
 
 		 545 aa  250  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.73 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  30.61 
 
 		 550 aa  246  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  28.01 
 
 		 564 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  31.36 
 
 		 549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  30.96 
 
 		 542 aa  245  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.23 
 
 		 548 aa  243  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  30.49 
 
 		 555 aa  241  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 		 666 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  30.83 
 
 		 630 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  27.23 
 
 		 658 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  27.16 
 
 		 649 aa  137  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  26.88 
 
 		 451 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  28.26 
 
 		 551 aa  128  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  28.24 
 
 		 466 aa  124  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  28.11 
 
 		 466 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  26.1 
 
 		 491 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  25.79 
 
 		 440 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  25.41 
 
 		 479 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  25.56 
 
 		 531 aa  110  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  26.08 
 
 		 444 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  24.88 
 
 		 444 aa  106  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  24.89 
 
 		 531 aa  106  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  26.2 
 
 		 462 aa  105  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  26.47 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  24.82 
 
 		 449 aa  101  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  23.56 
 
 		 494 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  24.52 
 
 		 451 aa  100  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  25.54 
 
 		 451 aa  99.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  24.11 
 
 		 509 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  24.11 
 
 		 509 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  25.12 
 
 		 451 aa  97.8  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  24.88 
 
 		 456 aa  97.4  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  24.47 
 
 		 488 aa  97.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  24.22 
 
 		 517 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  24.76 
 
 		 468 aa  96.3  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  21.88 
 
 		 499 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  24.73 
 
 		 479 aa  93.6  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.55 
 
 		 654 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  23.7 
 
 		 443 aa  93.2  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  23.11 
 
 		 590 aa  89  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  24.33 
 
 		 650 aa  86.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  23.99 
 
 		 463 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  24.8 
 
 		 652 aa  86.3  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  22.88 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  22.62 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  23.08 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  23.08 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  22.37 
 
 		 479 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  24.04 
 
 		 630 aa  75.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.19 
 
 		 633 aa  74.7  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  23.47 
 
 		 647 aa  74.3  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  22.82 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  24.49 
 
 		 1119 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  28.33 
 
 		 778 aa  50.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  20.96 
 
 		 925 aa  50.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  20.38 
 
 		 385 aa  50.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  22.48 
 
 		 773 aa  48.9  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  25.3 
 
 		 886 aa  48.9  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  23.53 
 
 		 794 aa  48.5  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  21.31 
 
 		 455 aa  48.5  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  24.24 
 
 		 786 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  22.73 
 
 		 698 aa  48.1  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  23.87 
 
 		 1004 aa  47  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  20.83 
 
 		 795 aa  46.6  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  24.12 
 
 		 796 aa  46.6  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  20.42 
 
 		 744 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>