More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33876 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  100 
 
 		 489 aa  969    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  41.44 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  46.07 
 
 		 438 aa  325  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  40.21 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  45.76 
 
 		 455 aa  312  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  41.53 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  42.68 
 
 		 437 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  40.53 
 
 		 437 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  41.68 
 
 		 449 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  37.81 
 
 		 442 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  39.84 
 
 		 428 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  39.88 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  38.97 
 
 		 436 aa  282  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  39.59 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  41.38 
 
 		 462 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  39.1 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  41.53 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  42.11 
 
 		 441 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  40.29 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 428 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 451 aa  277  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  40.97 
 
 		 457 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  41.89 
 
 		 444 aa  276  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  41.53 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  40.95 
 
 		 431 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 460 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  34.66 
 
 		 478 aa  272  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  40.12 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  39.23 
 
 		 445 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  38.97 
 
 		 428 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  38.52 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  35.88 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  35.8 
 
 		 441 aa  260  4e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  40.45 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  43.33 
 
 		 447 aa  257  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  45.94 
 
 		 550 aa  254  3e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  37.13 
 
 		 469 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0981  tRNA modification GTPase TrmE  42.45 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  37.68 
 
 		 455 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  38.18 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3756  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  37.07 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  36.79 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3495  tRNA modification GTPase TrmE  36.98 
 
 		 467 aa  240  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  37.1 
 
 		 462 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  37.65 
 
 		 456 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  34 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  34.63 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  34.63 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4112  tRNA modification GTPase TrmE  36.35 
 
 		 478 aa  238  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.712648  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  38.24 
 
 		 448 aa  237  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06522  mitochondrial GTPase (Mss1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04950)  34.27 
 
 		 614 aa  236  6e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.240099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4138  tRNA modification GTPase TrmE  37.23 
 
 		 486 aa  236  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619376  normal  0.415942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  36.33 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  36.33 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  36.33 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  37.88 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  36.33 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  36.33 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  36.31 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  35.57 
 
 		 453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  37.68 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 489 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  37.68 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  32.65 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  37.68 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 478 aa  233  5e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  36.18 
 
 		 454 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  36.49 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  33.81 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6055  tRNA modification GTPase TrmE  35.48 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  35.92 
 
 		 454 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 473 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  35.92 
 
 		 454 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  35.92 
 
 		 454 aa  231  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  35.92 
 
 		 454 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  35.92 
 
 		 454 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 		 471 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 466 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  36.94 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  35.21 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1783  tRNA modification GTPase TrmE  35.23 
 
 		 454 aa  230  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.028326  normal  0.377376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  36.22 
 
 		 453 aa  230  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3456  tRNA modification GTPase TrmE  36.31 
 
 		 475 aa  230  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  35.99 
 
 		 458 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  35.1 
 
 		 466 aa  229  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  34.41 
 
 		 518 aa  229  9e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  36.55 
 
 		 460 aa  229  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>