More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32265 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  100 
 
 		 863 aa  1779    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  40.6 
 
 		 868 aa  610  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  34.17 
 
 		 1009 aa  358  1.9999999999999998e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  36.48 
 
 		 641 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  32.07 
 
 		 629 aa  308  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  33.5 
 
 		 828 aa  306  7e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  29.63 
 
 		 780 aa  297  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  31.8 
 
 		 616 aa  290  7e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  31.52 
 
 		 855 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.72 
 
 		 610 aa  275  3e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  32.37 
 
 		 604 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  31.81 
 
 		 631 aa  270  1e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  32.58 
 
 		 604 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  33.55 
 
 		 602 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  32.85 
 
 		 596 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  26.92 
 
 		 747 aa  253  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  29.86 
 
 		 931 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  29.47 
 
 		 931 aa  245  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  29.94 
 
 		 935 aa  243  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.3 
 
 		 837 aa  240  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  27.72 
 
 		 837 aa  238  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  29.31 
 
 		 834 aa  237  8e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  28.46 
 
 		 942 aa  232  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  30.47 
 
 		 702 aa  226  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  28.34 
 
 		 771 aa  225  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.61 
 
 		 849 aa  224  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.73 
 
 		 938 aa  221  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  28.37 
 
 		 844 aa  221  6e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  26.98 
 
 		 744 aa  220  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  26.31 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  30.02 
 
 		 827 aa  210  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 863 aa  210  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  28.65 
 
 		 843 aa  201  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.21 
 
 		 864 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  27.17 
 
 		 868 aa  163  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 867 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  29.28 
 
 		 872 aa  161  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2033  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 871 aa  161  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1923  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 871 aa  161  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0924763  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2304  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 871 aa  160  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.926517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  22.21 
 
 		 853 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 865 aa  155  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 865 aa  155  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 865 aa  155  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 865 aa  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  28.35 
 
 		 865 aa  155  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 865 aa  155  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 865 aa  155  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 868 aa  154  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  28.16 
 
 		 865 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  26.56 
 
 		 869 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  26.56 
 
 		 869 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  26.56 
 
 		 869 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  28.52 
 
 		 876 aa  154  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 865 aa  154  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  21.79 
 
 		 812 aa  153  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2657  DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 865 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000104499  unclonable  0.0000000870588 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  22.14 
 
 		 814 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  26.64 
 
 		 865 aa  152  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 869 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  27.94 
 
 		 865 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  27.94 
 
 		 865 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  27.83 
 
 		 865 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  27.83 
 
 		 865 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  27.83 
 
 		 865 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  27.84 
 
 		 876 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  26.25 
 
 		 697 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  22.08 
 
 		 814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  26.86 
 
 		 866 aa  148  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  26.6 
 
 		 894 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  27.1 
 
 		 898 aa  147  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  27.11 
 
 		 868 aa  147  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  27.04 
 
 		 868 aa  147  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  25.74 
 
 		 896 aa  147  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  27.79 
 
 		 880 aa  146  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  26.6 
 
 		 894 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  26.93 
 
 		 868 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  27.03 
 
 		 879 aa  146  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1197  DNA topoisomerase I  26.36 
 
 		 899 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2114  DNA topoisomerase I  27.85 
 
 		 875 aa  145  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000002449 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  26.22 
 
 		 884 aa  145  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2841  DNA topoisomerase I  27.33 
 
 		 889 aa  145  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.598505  hitchhiker  0.00000400834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  26.78 
 
 		 868 aa  145  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  27.06 
 
 		 866 aa  145  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  25.87 
 
 		 892 aa  144  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  24.2 
 
 		 691 aa  145  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  22.22 
 
 		 817 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  27.54 
 
 		 880 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  27.54 
 
 		 880 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  27.54 
 
 		 880 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  28.07 
 
 		 880 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1164  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 879 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  26.78 
 
 		 876 aa  142  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2328  DNA topoisomerase I  26.67 
 
 		 895 aa  142  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.664503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  26.68 
 
 		 877 aa  142  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  26.6 
 
 		 894 aa  142  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  26.26 
 
 		 693 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  27.27 
 
 		 876 aa  140  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  26.36 
 
 		 879 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1803  DNA topoisomerase I  26.28 
 
 		 906 aa  138  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0789615  hitchhiker  0.0000387309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>