115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30717 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  100 
 
 
533 aa  1111    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  35.14 
 
 
493 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  33.86 
 
 
489 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  33.86 
 
 
510 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  32.72 
 
 
495 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  32.72 
 
 
495 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  32.99 
 
 
491 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  33.46 
 
 
501 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  30.72 
 
 
551 aa  233  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  32.63 
 
 
489 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  31.14 
 
 
488 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  31.16 
 
 
494 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  29.69 
 
 
497 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  30.48 
 
 
495 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  30.77 
 
 
494 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  29.69 
 
 
497 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  30.57 
 
 
494 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  30.69 
 
 
495 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  28.69 
 
 
507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  29.41 
 
 
464 aa  156  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  27.3 
 
 
554 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  25.89 
 
 
463 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  25.87 
 
 
483 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  26.54 
 
 
464 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  27.48 
 
 
765 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  26.95 
 
 
472 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  26 
 
 
502 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  25.81 
 
 
509 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  24.69 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  24.69 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  25.25 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  26.57 
 
 
514 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  25.6 
 
 
517 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  26.24 
 
 
460 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  26.15 
 
 
488 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  25.85 
 
 
480 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  28.09 
 
 
467 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  28.06 
 
 
467 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  27.8 
 
 
467 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  26.31 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  27.55 
 
 
441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  26.14 
 
 
504 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  26.53 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  27.46 
 
 
467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  25.71 
 
 
485 aa  118  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  25.52 
 
 
508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  25.52 
 
 
508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  25.14 
 
 
520 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  24.38 
 
 
477 aa  116  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  24.58 
 
 
555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  25.83 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43490  predicted protein  24.66 
 
 
630 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416955  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  24.02 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  24.28 
 
 
498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  23.71 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  24.02 
 
 
487 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  26.78 
 
 
467 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  24.07 
 
 
488 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  25.83 
 
 
494 aa  107  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  24.8 
 
 
914 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  25 
 
 
443 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  26.86 
 
 
470 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4021  predicted protein  35.29 
 
 
163 aa  101  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.274127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  26.13 
 
 
470 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  25.57 
 
 
445 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  22.92 
 
 
479 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  23.27 
 
 
443 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  23.27 
 
 
443 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  23.27 
 
 
443 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  23.27 
 
 
443 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  23.27 
 
 
443 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  23.27 
 
 
443 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  24.39 
 
 
481 aa  98.6  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  24.04 
 
 
487 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  24.54 
 
 
486 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  22.33 
 
 
515 aa  97.8  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  22.84 
 
 
443 aa  97.8  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  24.9 
 
 
445 aa  97.8  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  27.29 
 
 
459 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  25.88 
 
 
445 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.5 
 
 
473 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  24.95 
 
 
480 aa  94.7  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  24.8 
 
 
478 aa  94.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  25.98 
 
 
445 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  25.98 
 
 
445 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  23.01 
 
 
469 aa  93.6  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  26.24 
 
 
451 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  26.24 
 
 
451 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  22.97 
 
 
466 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  26.24 
 
 
451 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  23 
 
 
480 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  24.02 
 
 
477 aa  90.5  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  24.49 
 
 
496 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  24.49 
 
 
496 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  26.03 
 
 
444 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  24.28 
 
 
496 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  24.49 
 
 
512 aa  87  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.25 
 
 
461 aa  86.7  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  35.37 
 
 
556 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  35.37 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>