More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29714 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  62.79 
 
 
539 aa  673    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  59.19 
 
 
552 aa  652    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  100 
 
 
534 aa  1095    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  100 
 
 
534 aa  1095    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  56.87 
 
 
558 aa  624  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  51.5 
 
 
546 aa  549  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  36.83 
 
 
543 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  36.24 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.54 
 
 
551 aa  300  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  35.43 
 
 
542 aa  299  9e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  35.28 
 
 
559 aa  298  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  36.61 
 
 
552 aa  296  5e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  35.74 
 
 
557 aa  293  4e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  35.55 
 
 
558 aa  293  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  33.14 
 
 
555 aa  292  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  36.09 
 
 
547 aa  290  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  35.43 
 
 
553 aa  288  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  34.69 
 
 
551 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  34.65 
 
 
563 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  34.82 
 
 
560 aa  286  5e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  35.55 
 
 
560 aa  286  5e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  35.56 
 
 
554 aa  286  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  34.64 
 
 
545 aa  286  7e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  33.78 
 
 
559 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  34.56 
 
 
553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  34.78 
 
 
552 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  34.44 
 
 
558 aa  283  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  33.46 
 
 
562 aa  277  3e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  32.23 
 
 
553 aa  276  8e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  34.04 
 
 
545 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  34.23 
 
 
554 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  33.01 
 
 
543 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  34.05 
 
 
553 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  33.73 
 
 
539 aa  273  5.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  33.4 
 
 
554 aa  272  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.74 
 
 
537 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  33.46 
 
 
542 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  33.27 
 
 
551 aa  270  5.9999999999999995e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  34.38 
 
 
558 aa  269  7e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  33.85 
 
 
542 aa  269  7e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  33.01 
 
 
543 aa  269  8e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  34.5 
 
 
552 aa  268  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  31.63 
 
 
543 aa  267  4e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  34.04 
 
 
557 aa  266  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  33.72 
 
 
561 aa  264  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  32.09 
 
 
570 aa  262  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  32.42 
 
 
540 aa  259  7e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  32.95 
 
 
548 aa  258  2e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  33.92 
 
 
541 aa  252  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.01 
 
 
530 aa  249  6e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  32.24 
 
 
548 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  33.47 
 
 
500 aa  243  6e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.6 
 
 
527 aa  242  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.09 
 
 
536 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  33.27 
 
 
554 aa  242  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  30.74 
 
 
535 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.68 
 
 
555 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  32.95 
 
 
550 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  28.01 
 
 
553 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  28.01 
 
 
553 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  33.27 
 
 
549 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.18 
 
 
529 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.49 
 
 
525 aa  236  6e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  28.46 
 
 
527 aa  236  7e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.6 
 
 
546 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  28.4 
 
 
538 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  32 
 
 
528 aa  232  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  29.31 
 
 
547 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 
567 aa  228  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.53 
 
 
532 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.45 
 
 
528 aa  225  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.33 
 
 
519 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  28.73 
 
 
558 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.69 
 
 
525 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  28.63 
 
 
553 aa  216  7e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  29.33 
 
 
542 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  26.5 
 
 
559 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  28.7 
 
 
568 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  28.74 
 
 
541 aa  209  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  28.96 
 
 
536 aa  205  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  27.88 
 
 
523 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  28.57 
 
 
536 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  26.5 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  26.03 
 
 
570 aa  191  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  29.08 
 
 
548 aa  190  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  27.91 
 
 
533 aa  189  8e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  28.78 
 
 
535 aa  189  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  27.34 
 
 
550 aa  189  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  26.99 
 
 
530 aa  187  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  26.69 
 
 
551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  29.94 
 
 
548 aa  184  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  28.21 
 
 
527 aa  183  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  27.27 
 
 
577 aa  183  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  25.48 
 
 
542 aa  182  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  29.06 
 
 
529 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  26.02 
 
 
531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  26.58 
 
 
541 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  24.85 
 
 
563 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  25.37 
 
 
526 aa  164  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  25.56 
 
 
527 aa  153  7e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>