215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29705 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  100 
 
 
553 aa  1118    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  100 
 
 
553 aa  1118    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  29.43 
 
 
1999 aa  178  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  33.2 
 
 
464 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  32.13 
 
 
754 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  28.86 
 
 
611 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  30.21 
 
 
635 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  30.74 
 
 
650 aa  161  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  36.84 
 
 
479 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  30.74 
 
 
650 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  37.37 
 
 
1189 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  31.37 
 
 
797 aa  158  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  28.99 
 
 
636 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  30.99 
 
 
466 aa  156  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  28.57 
 
 
636 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  35.23 
 
 
1077 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  29.2 
 
 
655 aa  152  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  29.92 
 
 
609 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.9 
 
 
633 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  28.97 
 
 
2245 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  29.5 
 
 
632 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  32.29 
 
 
622 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  27.52 
 
 
716 aa  148  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  25.89 
 
 
643 aa  147  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  38.75 
 
 
268 aa  147  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  32.07 
 
 
622 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  26.72 
 
 
633 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  27.31 
 
 
633 aa  145  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  34.45 
 
 
795 aa  143  8e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  27.18 
 
 
633 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  31.07 
 
 
952 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  34.16 
 
 
1090 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  33.01 
 
 
388 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  25.93 
 
 
748 aa  131  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  37.55 
 
 
619 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  36.13 
 
 
651 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  33.22 
 
 
315 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  47.62 
 
 
219 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.27 
 
 
1099 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  31.77 
 
 
686 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  32.31 
 
 
1038 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  28.95 
 
 
1018 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  27.3 
 
 
1653 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.35 
 
 
752 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.83 
 
 
585 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  30.87 
 
 
941 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  34.02 
 
 
902 aa  98.2  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.97 
 
 
1203 aa  97.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.38 
 
 
715 aa  97.1  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  33.09 
 
 
934 aa  95.9  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  27.05 
 
 
1651 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  31.85 
 
 
902 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  31.1 
 
 
1151 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  30.95 
 
 
1048 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 
2310 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  29.08 
 
 
1585 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  29.08 
 
 
1585 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  29.83 
 
 
1620 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  33.09 
 
 
986 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.9 
 
 
629 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  32.43 
 
 
1270 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  28.37 
 
 
1108 aa  87.4  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  30.32 
 
 
486 aa  87  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  33.2 
 
 
901 aa  86.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  25.26 
 
 
1190 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  33.85 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  25.59 
 
 
944 aa  83.2  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  30.23 
 
 
1163 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  29.01 
 
 
521 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  32.88 
 
 
1143 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  31.16 
 
 
1228 aa  80.5  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  29.15 
 
 
1097 aa  80.1  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  28.8 
 
 
1350 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  32.43 
 
 
1143 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  32.43 
 
 
1143 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  30.07 
 
 
606 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.42 
 
 
1324 aa  78.2  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  29.02 
 
 
1247 aa  77.8  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  27.87 
 
 
1280 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  31.94 
 
 
1139 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  32.24 
 
 
1137 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  30.32 
 
 
1212 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  31.79 
 
 
1198 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  26.77 
 
 
1196 aa  75.1  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 
1196 aa  74.7  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  23.86 
 
 
1427 aa  74.7  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  25.94 
 
 
1175 aa  73.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  29.13 
 
 
1250 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.69 
 
 
769 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  28.91 
 
 
1215 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.61 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  30.43 
 
 
1082 aa  71.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  29.57 
 
 
1116 aa  71.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  28.79 
 
 
1126 aa  70.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  27.57 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.52 
 
 
932 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  28.52 
 
 
1126 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  28.06 
 
 
297 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  23.93 
 
 
1422 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  28.15 
 
 
922 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>