27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29541 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 
220 aa  453  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  56.4 
 
 
208 aa  245  4e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  56.8 
 
 
202 aa  234  9e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  59.9 
 
 
205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  56.59 
 
 
201 aa  229  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  41.94 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  37.11 
 
 
128 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  36.46 
 
 
125 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  36.56 
 
 
128 aa  60.1  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  35.48 
 
 
125 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  37.63 
 
 
125 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.691451 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  34.69 
 
 
133 aa  56.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  33.33 
 
 
126 aa  54.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  37.25 
 
 
125 aa  52.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  39.36 
 
 
124 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  36.46 
 
 
125 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  36.17 
 
 
125 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  36.08 
 
 
125 aa  51.6  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  29.9 
 
 
128 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  32.32 
 
 
128 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  35.48 
 
 
123 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  39.78 
 
 
123 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0520  30S ribosomal protein S8e  34 
 
 
127 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  31.31 
 
 
128 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  31.31 
 
 
128 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  31.91 
 
 
131 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.14774 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  32.67 
 
 
123 aa  45.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.111484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>