More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28310 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009371  OSTLU_28310  Diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 471 aa  964    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0114023  hitchhiker  0.00277036 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21592  diaminopimelate decarboxylase  58.14 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1995  diaminopimelate decarboxylase  39.53 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000281435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3033  Diaminopimelate decarboxylase  37.79 
 
 		 439 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0219  diaminopimelate decarboxylase  38.5 
 
 		 439 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279526  hitchhiker  6.0222499999999995e-21 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3483  diaminopimelate decarboxylase  38.01 
 
 		 412 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4883  diaminopimelate decarboxylase  38.01 
 
 		 412 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5403  diaminopimelate decarboxylase  38.01 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4771  diaminopimelate decarboxylase  38.17 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0837  diaminopimelate decarboxylase  37.98 
 
 		 412 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 412 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4246  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7089  diaminopimelate decarboxylase  36.9 
 
 		 413 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5726  diaminopimelate decarboxylase  37.26 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  35.35 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  35.35 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  35.35 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  35.35 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  35.11 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  35.35 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  35.11 
 
 		 420 aa  225  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2002  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 415 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  34.87 
 
 		 420 aa  223  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3284  diaminopimelate decarboxylase  35.19 
 
 		 420 aa  223  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  35.11 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  35.92 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  34.15 
 
 		 410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3345  diaminopimelate decarboxylase  35.28 
 
 		 420 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0295344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3163  diaminopimelate decarboxylase  35.05 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3244  diaminopimelate decarboxylase  35.05 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  33.9 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  35.51 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3229  diaminopimelate decarboxylase  34.81 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  34.39 
 
 		 410 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0753  diaminopimelate decarboxylase  35.39 
 
 		 420 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3625  diaminopimelate decarboxylase  35.59 
 
 		 420 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1818  diaminopimelate decarboxylase  35.08 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0661432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3181  diaminopimelate decarboxylase  34.58 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1645  diaminopimelate decarboxylase  35.51 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0733  diaminopimelate decarboxylase  35.78 
 
 		 420 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3486  diaminopimelate decarboxylase  35.11 
 
 		 420 aa  207  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1024  diaminopimelate decarboxylase  34.4 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3248  diaminopimelate decarboxylase  34.17 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0973  diaminopimelate decarboxylase  34.17 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4766  diaminopimelate decarboxylase  34.6 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  32.14 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  30.48 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  30.98 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  30.64 
 
 		 424 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  30.46 
 
 		 398 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  31.48 
 
 		 410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  29.86 
 
 		 416 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  29.27 
 
 		 434 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  29.44 
 
 		 421 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  29.54 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  28.67 
 
 		 425 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  30.07 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.13 
 
 		 859 aa  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  30.87 
 
 		 859 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  31.08 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  31.82 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  32.79 
 
 		 432 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  30.39 
 
 		 429 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  32.83 
 
 		 878 aa  143  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1053  diaminopimelate decarboxylase  30.56 
 
 		 458 aa  143  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.861814  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  30.16 
 
 		 857 aa  139  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  29.74 
 
 		 430 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  32 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  28.01 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0790  diaminopimelate decarboxylase  31.7 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.867864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0798  diaminopimelate decarboxylase  30.95 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  29 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  29.36 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2862  diaminopimelate decarboxylase  30.07 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0197535  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  27.73 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  32.02 
 
 		 421 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0744  diaminopimelate decarboxylase  31.62 
 
 		 438 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  31.46 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  30.37 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  30.77 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  29.72 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  30.31 
 
 		 415 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  31.69 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  31.37 
 
 		 421 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  29.75 
 
 		 417 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  31.37 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  29.2 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  30.39 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  28.74 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  29.45 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4876  diaminopimelate decarboxylase  28.34 
 
 		 416 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000066198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  29.52 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  30.12 
 
 		 421 aa  127  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  29.95 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  28.6 
 
 		 420 aa  126  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3166  diaminopimelate decarboxylase  27.54 
 
 		 413 aa  126  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.603838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  29.29 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  27.83 
 
 		 418 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09810  diaminopimelate decarboxylase  28.22 
 
 		 462 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>