46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28283 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  100 
 
 		 1742 aa  3583    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  31.06 
 
 		 1701 aa  262  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  28.14 
 
 		 938 aa  243  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  25.4 
 
 		 1546 aa  173  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  35.74 
 
 		 256 aa  157  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  25.31 
 
 		 2028 aa  125  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  26.02 
 
 		 2110 aa  120  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51869  calcium channel protein  22.86 
 
 		 2206 aa  107  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.56529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  25.45 
 
 		 315 aa  92.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  24.82 
 
 		 278 aa  78.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  25.25 
 
 		 274 aa  77.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  25.45 
 
 		 328 aa  74.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  22.93 
 
 		 273 aa  73.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  23.53 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  26.78 
 
 		 258 aa  72  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  23.72 
 
 		 281 aa  71.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  30.82 
 
 		 282 aa  71.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  23.74 
 
 		 291 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  22.1 
 
 		 276 aa  71.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  28.31 
 
 		 278 aa  70.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  23.9 
 
 		 274 aa  70.5  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  23.74 
 
 		 282 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  25.38 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  28.03 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  21.71 
 
 		 276 aa  67.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  27.56 
 
 		 274 aa  67.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  28.22 
 
 		 261 aa  67  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  23.77 
 
 		 304 aa  67  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  24.28 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  23.23 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  23.44 
 
 		 295 aa  65.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  22.76 
 
 		 290 aa  65.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  25.49 
 
 		 261 aa  63.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  27.59 
 
 		 262 aa  63.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  25.83 
 
 		 300 aa  60.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  20.89 
 
 		 1012 aa  59.3  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  27.27 
 
 		 292 aa  55.5  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  24.58 
 
 		 312 aa  55.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  23.89 
 
 		 269 aa  53.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  22.3 
 
 		 290 aa  53.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  28.45 
 
 		 277 aa  53.5  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  23.32 
 
 		 718 aa  50.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  24.7 
 
 		 415 aa  49.3  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  25.49 
 
 		 280 aa  47.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  24.76 
 
 		 469 aa  47.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  22.71 
 
 		 289 aa  47  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>