25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27308 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  100 
 
 
247 aa  485  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  45.45 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  38.71 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  35.35 
 
 
211 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  35.05 
 
 
192 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  37.23 
 
 
194 aa  52.8  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  34.02 
 
 
195 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  31.68 
 
 
193 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  36 
 
 
209 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  30.43 
 
 
188 aa  52  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  34.41 
 
 
188 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  30.21 
 
 
190 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  31.52 
 
 
182 aa  48.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  34.38 
 
 
185 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  37.25 
 
 
189 aa  45.4  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  30.3 
 
 
200 aa  45.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  41.54 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01081  hypothetical protein  38.37 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.101815  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  44.62 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  35.35 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  25.56 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  26.97 
 
 
188 aa  42.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  39.13 
 
 
1128 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  29.52 
 
 
183 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  32 
 
 
195 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>