85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27050 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  100 
 
 
164 aa  328  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  36.11 
 
 
117 aa  57.4  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  37.78 
 
 
118 aa  55.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  36.04 
 
 
118 aa  54.7  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  37.5 
 
 
118 aa  51.2  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  37.5 
 
 
118 aa  50.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 
114 aa  50.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  37.78 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  36.67 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  36.67 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  36.67 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  36.67 
 
 
118 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  36.67 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4203  ribonuclease P protein  42.86 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0154701  decreased coverage  0.00202105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  39.77 
 
 
119 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  38.3 
 
 
116 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  40.45 
 
 
128 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  37.21 
 
 
118 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  35.63 
 
 
107 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  42.86 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  42.59 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 
131 aa  47.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  40.51 
 
 
139 aa  47.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  36.67 
 
 
120 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  29.57 
 
 
131 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  36.67 
 
 
118 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  36.67 
 
 
118 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  36.67 
 
 
120 aa  47.4  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  36.67 
 
 
118 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  36.67 
 
 
118 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  36.67 
 
 
119 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  32.67 
 
 
126 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  53.33 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  35.56 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  32.46 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  33.72 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  31.87 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  33.68 
 
 
116 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  47.17 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  36.78 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  37.78 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  37.63 
 
 
119 aa  45.1  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  34.44 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.75 
 
 
132 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  37.93 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  39.53 
 
 
119 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  28.06 
 
 
136 aa  44.7  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  39.53 
 
 
119 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  39.53 
 
 
119 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  39.53 
 
 
119 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  39.53 
 
 
119 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  44.44 
 
 
130 aa  44.3  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  39.53 
 
 
119 aa  43.9  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  38.37 
 
 
119 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  38.37 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  38.75 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0357  hypothetical protein  61.29 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380253 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  38.37 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  38.37 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  38.37 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  38.37 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  45 
 
 
126 aa  43.9  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  38.37 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  29.09 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  36.67 
 
 
135 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  35.8 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0001  ribonuclease P protein component  33.98 
 
 
123 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0001269  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  39.68 
 
 
134 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  31.37 
 
 
120 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2826  ribonuclease P protein component  43.4 
 
 
99 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  36.25 
 
 
140 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  28.3 
 
 
115 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  39.68 
 
 
134 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1229  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 
122 aa  41.2  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0151351  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  31.33 
 
 
119 aa  41.2  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  39.68 
 
 
134 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  29.25 
 
 
115 aa  40.8  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  26.26 
 
 
109 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  51.16 
 
 
108 aa  40.8  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  28.3 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  30.49 
 
 
152 aa  40.8  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  32.41 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>