136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26493 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009365  OSTLU_26493  predicted protein  100 
 
 		 994 aa  2050    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  27.91 
 
 		 1009 aa  259  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00930  DNA ligase (ATP), putative  26.67 
 
 		 1065 aa  186  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  23.99 
 
 		 939 aa  175  5e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45463  predicted protein  23.99 
 
 		 1307 aa  148  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.857955  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50218  predicted protein  23.99 
 
 		 1307 aa  148  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  24.86 
 
 		 549 aa  135  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  25.54 
 
 		 719 aa  129  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  23.92 
 
 		 803 aa  123  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.09 
 
 		 601 aa  118  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.17 
 
 		 588 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  24.2 
 
 		 583 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.78 
 
 		 582 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  24.11 
 
 		 932 aa  109  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  21.14 
 
 		 583 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  25.95 
 
 		 664 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  24.11 
 
 		 546 aa  104  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.38 
 
 		 592 aa  102  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  22.14 
 
 		 598 aa  101  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  23.94 
 
 		 584 aa  100  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.95 
 
 		 553 aa  98.6  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.56 
 
 		 556 aa  98.6  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  21.84 
 
 		 601 aa  98.2  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  27.04 
 
 		 651 aa  98.2  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.14 
 
 		 552 aa  97.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  23.81 
 
 		 567 aa  97.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  23.75 
 
 		 584 aa  94  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.79 
 
 		 548 aa  90.9  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  23.2 
 
 		 603 aa  90.5  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.86 
 
 		 510 aa  90.1  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.56 
 
 		 610 aa  89.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.51 
 
 		 522 aa  89  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.88 
 
 		 1017 aa  88.2  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  22.42 
 
 		 576 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  22.28 
 
 		 584 aa  86.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  22.61 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.68 
 
 		 550 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.03 
 
 		 562 aa  82.8  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.28 
 
 		 573 aa  82.4  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  24.95 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.08 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.01 
 
 		 573 aa  80.5  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.93 
 
 		 573 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  25.36 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  24.48 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  21.17 
 
 		 590 aa  74.7  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.64 
 
 		 594 aa  72.8  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  24.22 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  25.85 
 
 		 527 aa  70.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.64 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  21.84 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.33 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  26.67 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  20.58 
 
 		 531 aa  67.4  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  23.06 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  24.17 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  24.07 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  22.37 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  24.77 
 
 		 944 aa  64.7  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  25.39 
 
 		 318 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  22.39 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  21.53 
 
 		 551 aa  62  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  27.13 
 
 		 845 aa  60.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  28.74 
 
 		 321 aa  60.1  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  22.22 
 
 		 532 aa  56.2  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  22.22 
 
 		 545 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  23.63 
 
 		 344 aa  55.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  30.68 
 
 		 815 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  22.83 
 
 		 902 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  23.36 
 
 		 818 aa  54.7  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  23.34 
 
 		 648 aa  54.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  31.15 
 
 		 503 aa  54.3  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  28.65 
 
 		 537 aa  53.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  21.17 
 
 		 546 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.83 
 
 		 506 aa  53.5  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  24.49 
 
 		 684 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  20.65 
 
 		 816 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  21.13 
 
 		 546 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  22.6 
 
 		 558 aa  52.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  20.92 
 
 		 546 aa  52.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  25 
 
 		 390 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  27.54 
 
 		 436 aa  51.6  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.32 
 
 		 778 aa  51.6  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2161  ATP dependent DNA ligase  24.55 
 
 		 313 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  24.82 
 
 		 855 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3044  ATP-dependent DNA ligase  24.44 
 
 		 563 aa  50.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2316  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  24.55 
 
 		 313 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  23.31 
 
 		 495 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  22.82 
 
 		 813 aa  50.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  22.45 
 
 		 646 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  22.3 
 
 		 630 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  22.04 
 
 		 877 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  31.62 
 
 		 882 aa  48.9  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 508 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 366 aa  48.9  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  27.66 
 
 		 509 aa  48.9  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  22.74 
 
 		 535 aa  48.5  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  25.62 
 
 		 828 aa  48.5  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  25.1 
 
 		 357 aa  48.5  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  31.43 
 
 		 363 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>