100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_23838 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 		 386 aa  793    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  64.6 
 
 		 390 aa  528  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  64.69 
 
 		 392 aa  525  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  63.19 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  60.47 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  37.26 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  36.36 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  36.41 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  36.14 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  35.87 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  33.42 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  34.89 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  34.51 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  37.5 
 
 		 335 aa  202  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  33.61 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  34.84 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  33.7 
 
 		 337 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  33.52 
 
 		 337 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  34.82 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  31.96 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  33.97 
 
 		 339 aa  190  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  35.88 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  34.99 
 
 		 338 aa  189  9e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  35.44 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  34.99 
 
 		 338 aa  189  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  32.51 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  31.29 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  34.99 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  33.96 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  30.96 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  36.34 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  32.21 
 
 		 334 aa  171  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  31.32 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  27.39 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  31.21 
 
 		 213 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1851  50S ribosomal protein L3  41.25 
 
 		 236 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  28.17 
 
 		 211 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  29.71 
 
 		 213 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  28.28 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  27.59 
 
 		 209 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  40.74 
 
 		 205 aa  50.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  40.24 
 
 		 216 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  38.75 
 
 		 210 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  30 
 
 		 211 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  37.35 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  37.8 
 
 		 205 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  25.55 
 
 		 208 aa  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  26.47 
 
 		 208 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  24.49 
 
 		 226 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1988  50S ribosomal protein L3  37.5 
 
 		 236 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  36.78 
 
 		 210 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  35.8 
 
 		 205 aa  47.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  36.9 
 
 		 205 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  28.78 
 
 		 219 aa  46.6  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  34.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  33.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  31.25 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1975  50S ribosomal protein L3  37.5 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  34.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  38.27 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  34.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  31.82 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  33.73 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  34.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  34.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  27.14 
 
 		 209 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  34.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  34.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  34.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1890  50S ribosomal protein L3  37.5 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  29.57 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  34.18 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  34.18 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  33.93 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  34.67 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  35.87 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  36.14 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  35.8 
 
 		 216 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  38.27 
 
 		 216 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  32.04 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  34.18 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 205 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0265  50S ribosomal protein L3  36.36 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658657  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  22.35 
 
 		 272 aa  44.3  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  34.62 
 
 		 213 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  27.34 
 
 		 207 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  27.34 
 
 		 207 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  38.27 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  33.04 
 
 		 219 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  35.23 
 
 		 220 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  28.4 
 
 		 223 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  25.53 
 
 		 207 aa  43.5  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  28.86 
 
 		 220 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  40.58 
 
 		 206 aa  43.1  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  26.43 
 
 		 211 aa  43.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  32.91 
 
 		 210 aa  43.1  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  40.74 
 
 		 216 aa  43.1  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  31.4 
 
 		 211 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  31.4 
 
 		 211 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>