30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_2293 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  100 
 
 
432 aa  873    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_006686  CND03210  Ran GTPase activator, putative  31.9 
 
 
404 aa  99  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04862  Ran specific GTPase activating protein An-RanGAP (Eurofung)  29.58 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.863304  normal  0.748765 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  26.95 
 
 
692 aa  76.6  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54869  predicted protein  25.78 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  26.2 
 
 
471 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81269  predicted protein  24.86 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446768  normal  0.64637 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  27.6 
 
 
466 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  25.08 
 
 
614 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  29.31 
 
 
781 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  28.64 
 
 
241 aa  63.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  28.93 
 
 
591 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  24.81 
 
 
815 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  26.75 
 
 
430 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  30.74 
 
 
401 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  26.98 
 
 
464 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  25.99 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  28.96 
 
 
620 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  26.32 
 
 
770 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  25.71 
 
 
897 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  25.8 
 
 
372 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  22.39 
 
 
510 aa  53.5  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88061  predicted protein  26.17 
 
 
936 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0276819  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1940  hypothetical protein  27.88 
 
 
534 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  26.33 
 
 
522 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.46 
 
 
344 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  29.08 
 
 
262 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  29.08 
 
 
262 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  33.05 
 
 
807 aa  43.5  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  31.6 
 
 
661 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>