10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_18116 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009368  OSTLU_18116  predicted protein  100 
 
 		 2283 aa  4681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00383988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27430  predicted protein  98.23 
 
 		 4434 aa  4489    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.684907 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4555  predicted protein  29.77 
 
 		 354 aa  137  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75133  vacuolar sorting  21.86 
 
 		 3109 aa  108  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.268432 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05579  vacuolar protein sorting-associated protein vps13 (AFU_orthologue; AFUA_4G11560)  23.25 
 
 		 3169 aa  89  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105192  normal  0.590199 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44551  predicted protein  22.33 
 
 		 3905 aa  64.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02260  late endosome to vacuole transport-related protein, putative  20.1 
 
 		 3181 aa  63.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47968  predicted protein  30.38 
 
 		 4524 aa  53.5  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0329  hypothetical protein  36.84 
 
 		 462 aa  52.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27506  predicted protein  34.21 
 
 		 1558 aa  46.6  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>